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Les boiteries chez les bovins sont une préoccupation majeure en élevage, à l'origine d'une dégradation du bien-être animal et de la productivité. La très grande majorité des boiteries sont liées à des affections du pied. L'investigation des facteurs de risque, pierre angulaire de la prévention et la maitrise des boiteries d'origine podales, est grandement facilitée et améliorée par l'enregistrement standardisé d'informations relatives aux lésions podales objectivées lors du parage. Plusieurs applications informatiques existent sur le marché pour l'enregistrement des lésions podales mais aucune ne semble répondre parfaitement aux besoins des utilisateurs. Une nouvelle application a été développée dans le but de proposer une solution la plus ergonomique et complète possible. L'application réalisée répond aux critères d'enregistrement et de suivi des lésions podales en proposant un aspect pédagogique et la possibilité de prendre des photographies. Dans la version actuellement disponible de notre application l'analyse des données reste cependant limitée mais pourra être améliorée dès lors que la brique serveur sera construite et que des passerelles avec les services extérieurs comme les registres d'élevage pourront être établies. La version actuelle est toutefois pleinement opérationnelle pour la saisie des lésions podales et fait l'objet de plusieurs tests convaincants par des vétérinaires praticiens.
[-] Les boiteries chez les bovins sont une préoccupation majeure en élevage, à l'origine d'une dégradation du bien-être animal et de la productivité. La très grande majorité des boiteries sont liées à des affections du pied. L'investigation des facteurs de risque, pierre angulaire de la prévention et la maitrise des boiteries d'origine podales, est grandement facilitée et améliorée par l'enregistrement standardisé d'informations relatives aux ...
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L'objectif principal de cette thèse est la participation au développement d'un logiciel vétérinaire, principalement pour les parties d'aides au diagnostic et au pronostic. Ce travail s'est basé sur la recherche bibliographique d'articles scientifiques définissant l'examen clinique d'un bovin, certaines affections d'intérêt en élevage laitier et certains signes cliniques et paracliniques pouvant apporter de nombreuses informations au vétérinaire. Notre thèse a d'abord permis de définir un examen clinique exhaustif d'un bovin. Ensuite, nous avons déterminé les dix affections les plus importantes en élevage laitier en nous basant sur des critères de fréquence, de gravité médicale et d'impact économique. Nous avons alors listé l'ensemble des signes cliniques pouvant apparaître lors de chacune de ces affections. Parmi ces signes cliniques, nous avons enfin déterminé lesquels apportaient la plus grande valeur pronostique dans le cadre de chaque affection. Ce travail a donc permis de créer une liste de signes cliniques ayant une forte valeur diagnostique ou pronostique. Cette liste permettra ensuite la création d'un logiciel à destination des vétérinaires, leur octroyant une aide supplémentaire pour le diagnostic et le pronostic pour quelques affections importantes en élevage laitier. Cependant, l'examen clinique exhaustif est purement théorique et n'est pas réalisable sur le terrain au chevet d'un animal malade. De même, les examens cliniques et paracliniques à forte valeur diagnostique ou pronostique ne sont pas toujours réalisables sur le terrain, notamment pour des raisons économiques et pratiques. Les perspectives de ce travail sont de l'étendre à un plus grand nombre d'affections, plus rares ou bien présentes seulement en élevage allaitant. Bien que ce ne soit pas l'objectif premier de cette thèse, ce travail pourrait également être utilisé à des fins pédagogiques pour les étudiants vétérinaires.
[-] L'objectif principal de cette thèse est la participation au développement d'un logiciel vétérinaire, principalement pour les parties d'aides au diagnostic et au pronostic. Ce travail s'est basé sur la recherche bibliographique d'articles scientifiques définissant l'examen clinique d'un bovin, certaines affections d'intérêt en élevage laitier et certains signes cliniques et paracliniques pouvant apporter de nombreuses informations au vétérinaire. ...
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Le changement des pratiques opéré depuis plusieurs années en élevages bovins s'est accompagné d'un développement technique et technologiques. Un des exemples le plus parlant concerne la reproduction dont la gestion est facilitée par la progression des logiciels d'aide. Ce travail de thèse s'est attaché à analyser le fonctionnement du taux de gestation, indicateur chiffré dont l'utilisation est récente. Les résultats obtenus montrent une différence notable entre le logiciel d'étude (Venotis ®) et le calcul de référence. Il a été noté certains biais de fonctionnement de calculs des algorithmes, expliqués par des cas particuliers non anticipés, ainsi que par la frontière existante entre la définition théorique d'un paramètre et son utilisation formatée au sein d'un algorithme. Ce travail permet de proposer plusieurs améliorations de méthodologie pour le calcul du taux de gestation, mais aussi pour d'autres statistiques de reproduction, afin d'uniformiser les résultats et gagner en précision.
[-] Le changement des pratiques opéré depuis plusieurs années en élevages bovins s'est accompagné d'un développement technique et technologiques. Un des exemples le plus parlant concerne la reproduction dont la gestion est facilitée par la progression des logiciels d'aide. Ce travail de thèse s'est attaché à analyser le fonctionnement du taux de gestation, indicateur chiffré dont l'utilisation est récente. Les résultats obtenus montrent une ...
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Le bien-être animal est un des objectifs des parcs zoologiques. Sa définition évolue au cours du temps et son évaluation se réalise aujourd'hui au sein des institutions suivant des modèles proposés. Ces modèles aboutissent à des méthodes d'évaluation instantanées du bien-être, par des grilles générales pour plusieurs espèces. Cette étude a mené à la création d'un logiciel d'évaluation du bien-être du grand dauphin (Tursiops truncatus) au sein de la Cité Marine, delphinarium de Planète Sauvage. La captivité de ces cétacés est en effet aujourd'hui au cœur des débats et suscite un intérêt croissant de la part de l'opinion publique et des gouvernements. Ce logiciel est un outil destiné aux soigneurs afin de leur permettre d'optimiser et d'améliorer au quotidien le bien-être de ces grands dauphins évoluant au sein du centre de recherche. Cette étude révèle également les difficultés rencontrées, notamment dans le choix des critères scientifiques objectifs de l'évaluation du bien-être animal, mais également pour l'utilisation pratique de ce logiciel.
[-] Le bien-être animal est un des objectifs des parcs zoologiques. Sa définition évolue au cours du temps et son évaluation se réalise aujourd'hui au sein des institutions suivant des modèles proposés. Ces modèles aboutissent à des méthodes d'évaluation instantanées du bien-être, par des grilles générales pour plusieurs espèces. Cette étude a mené à la création d'un logiciel d'évaluation du bien-être du grand dauphin (Tursiops truncatus) au sein de ...
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L'anatomie constitue le socle indispensable à la pratique de la médecine, et son apprentissage est une étape indispensable à toute personne se targuant de vouloir devenir vétérinaire. Dans un contexte de course à la technologie et de développement des connaissances et des techniques médicales, la médecine humaine a pris les devants et a déjà développé de nombreux logiciels et sites internet interactifs d'anatomie en trois dimensions. Le projet AnatoPlus ®, né en 2012, développe à son tour un tel logiciel en modélisant l'anatomie du chien en trois dimensions de manière fiable et réaliste tout en respectant un cadre éthique. Ce logiciel dépasse le cadre de la pédagogie et est également voué à fournir un outil pratique à l'ensemble des vétérinaires praticiens. Après le développement des modules d'ostéologie et de myologie, la création du module d'angiologie a débuté en 2019 avec l'élaboration d'une modélisation 3D du système artériel du chien. Cette présente thèse est vouée à compléter ce module en apposant à la modélisation préalablement établie le système veineux du chien. Pour ce faire, dans un premier temps, une cartographie bibliographique a été établie en association avec une carte heuristique représentant le système veineux du chien. Le protocole expérimental développé afin de construire la modélisation des veines satellites et non satellites est présenté en seconde partie. Enfin, la dernière partie présente les résultats obtenus sur le logiciel AnatoPlus ® permettant de visualiser l'ensemble du système vasculaire du chien, telle qu'abouti à ce jour, et de discuter des enjeux et de l'avenir des logiciels d'anatomie en trois dimensions.
[-] L'anatomie constitue le socle indispensable à la pratique de la médecine, et son apprentissage est une étape indispensable à toute personne se targuant de vouloir devenir vétérinaire. Dans un contexte de course à la technologie et de développement des connaissances et des techniques médicales, la médecine humaine a pris les devants et a déjà développé de nombreux logiciels et sites internet interactifs d'anatomie en trois dimensions. Le projet ...
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SI2A, système d'information sur l'inspection en abattoir, est un logiciel de recueil des données de l'inspection sanitaire réalisée par des agents de l'État, les services vétérinaires d'inspection (SVI), à l'abattoir en France. Cette thèse constitue une étude bi-disciplinaire portant à la fois sur une analyse exploratoire des données d'inspection post mortem des gros bovins en France métropolitaine de 2016 à 2019 et sur une analyse sociologique des retours d'expériences d'utilisateurs et de concepteurs de SI2A à travers dix entretiens semi-directifs. La première étude a indiqué que le système SI2A constitue une base de données exhaustive et fiable. Son exploitation a permis de caractériser les différents taux et motifs de saisies ainsi que leurs facteurs de risque. Cette valorisation reste cependant limitée par des freins techniques dus à la conception du système ou de son utilisation. La seconde étude a montré que SI2A est un outil proche du terrain dont les avantages sont reconnus. La volonté initiale de créer une base de données étanche qui ne permette pas l'accès aux données d'inspection par le professionnel a été respectée. Ces qualités ont été rendues possibles par l'utilisation de la méthode Agile permettant la rencontre régulière des concepteurs et des futurs utilisateurs. Les SVI utilisent SI2A pour enregistrer les données sanitaires mais son outil de valorisation de données, DEDAL, est peu utilisé par les agents en abattoir malgré un intérêt de leur part. Les interrogés ont donc de nombreuses attentes vis-à-vis de cet outil au fort potentiel. Finalement, cette double étude a identifié des points d'amélioration sur différents axes : (i) l'enregistrement des données, (ii) la valorisation des données, (iii) la formation à l'utilisation du système, (iv) la communication autour de ce système.
[-] SI2A, système d'information sur l'inspection en abattoir, est un logiciel de recueil des données de l'inspection sanitaire réalisée par des agents de l'État, les services vétérinaires d'inspection (SVI), à l'abattoir en France. Cette thèse constitue une étude bi-disciplinaire portant à la fois sur une analyse exploratoire des données d'inspection post mortem des gros bovins en France métropolitaine de 2016 à 2019 et sur une analyse sociologique ...
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Lors du suivi de reproduction en élevage bovin, le vétérinaire réalise des examens gynécologiques systématiques à des moments clés du cycle reproductif de la vache ; il s'intéresse également à de multiples données d'élevage dans l'objectif d'optimiser la reproduction. Cette thèse, à travers une enquête conduite auprès de vétérinaires français ayant une activité de suivi de reproduction en élevage bovin laitier, s'intéresse aux données utilisées pour le suivi de reproduction, aux différentes passerelles permettant l'accès à ces données, ainsi qu'aux solutions informatiques existantes permettant de gérer cette activité de suivi de reproduction. Les résultats de cette enquête ont permis de montrer une amélioration de l'accès aux données d'élevage, notamment pour les vétérinaires ayant recours à une solution informatique, même s'il subsiste encore de nombreuses lacunes à l'image des données encore impossibles à récupérer ainsi que des problèmes de concurrence avec les autres organismes de conseil concernant ces données d'élevage. Si la saisie des données reste un passage obligatoire pour de nombreux vétérinaires, le développement des passerelles entre les bases de données éleveurs et les logiciels de suivi de reproduction facilite l'échange des données, ce qui représente un gain de temps considérable pour le vétérinaire comme pour l'éleveur. Différents projets menés par l'ensemble des acteurs de la filière sont d'ailleurs en cours de développement pour améliorer la mise à disposition, la circulation et l'utilisation de ces données. Les logiciels de suivi de reproduction sont de plus en plus utilisés par les vétérinaires, avec VetElevage® et Milk'up® comme leaders du marché. Parmi les critères de choix mis en avant par les vétérinaires figurent le recueil des données, la simplicité d'utilisation, la polyvalence et la performance du logiciel et enfin la disponibilité et la réactivité du support technique. Chaque logiciel présente des avantages et des inconvénients mais les solutions « artisanales » ne semblent plus en mesure d'égaler les logiciels commerciaux développés pour le suivi d'élevage.
[-] Lors du suivi de reproduction en élevage bovin, le vétérinaire réalise des examens gynécologiques systématiques à des moments clés du cycle reproductif de la vache ; il s'intéresse également à de multiples données d'élevage dans l'objectif d'optimiser la reproduction. Cette thèse, à travers une enquête conduite auprès de vétérinaires français ayant une activité de suivi de reproduction en élevage bovin laitier, s'intéresse aux données utilisées ...
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La formation vétérinaire est très exigeante et nécessite l'acquisition d'une grande quantité de connaissances et compétences dans une durée d'enseignement non extensible. Dans le tronc commun, l'enseignement de la médecine équine à l'EnvA est particulièrement contraint en termes de volume horaire, ce qui entraîne inexorablement des lacunes qu'il faut combler en cinquième année. L'une d'elle réside dans le fossé qui existe entre l'enseignement magistral théorique et l'immersion dans la pratique au sein de la Clinique Equine d'Alfort. La présente thèse a pour but d'introduire, au sein de l'enseignement de la médecine équine, un outil pédagogique déjà bien connu et apprécié dans d'autres matières : le cas clinique interactif virtuel. Cet outil d'auto-apprentissage favorise l'apprentissage actif par erreur. Il est disponible sur la plateforme EVE de l'EnvA, et s'adresse aux étudiants de troisième, quatrième et cinquième année. Il a pour objectif de constituer une passerelle entre la théorie et la pratique dans le sens où l'étudiant peut se confronter à un cas réel de colique et mobiliser les connaissances acquises en cours magistral. Il doit permettre à l'étudiant de se familiariser avec la démarche diagnostique avant son arrivée en clinique et de ce fait tirer un plus grand bénéfice de ses rotations clinique en médecine équine. Le module a été testé par des étudiants et vétérinaires diplômés volontaires. Il a été bien accueilli et son potentiel pédagogique a été reconnu. Sa principale limite réside dans l'unicité du cas, ne permettant pas de généraliser le raisonnement clinique. Le présent manuscrit expose les raisons qui nous ont poussés à réaliser ce projet, il détaille ensuite les grandes étapes de la création de ce cas clinique et fait l'objet pour finir, d'une discussion au sujet de son intérêt pédagogique.
[-] La formation vétérinaire est très exigeante et nécessite l'acquisition d'une grande quantité de connaissances et compétences dans une durée d'enseignement non extensible. Dans le tronc commun, l'enseignement de la médecine équine à l'EnvA est particulièrement contraint en termes de volume horaire, ce qui entraîne inexorablement des lacunes qu'il faut combler en cinquième année. L'une d'elle réside dans le fossé qui existe entre l'enseignement ...
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L'anatomie est une des sciences de base dans l'enseignement de la médecine vétérinaire. Depuis quelques décennies, la méthode d'enseignement, en particulier de l'anatomie, est en constante évolution. Les outils disponibles aujourd'hui permettent d'envisager autrement l'apprentissage de cette discipline. Dans ce contexte, un projet de logiciel d'anatomie vétérinaire en trois dimensions est en construction : AnatoPlus. Cette thèse présente une étape de la construction de ce logiciel : la myologie de la tête chez le chien. Le but est de rédiger les informations qui figureront dans le logiciel se rapportant à chaque muscle étudié et de fournir des photographies afin de faciliter le travail futur de modélisation des muscles, pour que le rendu visuel se rapproche de ce qu'on observerait en réalité. Dans un premier temps, une partie bibliographique permettra de faire le point sur le projet et son avancement ainsi que sur l'intérêt de la modélisation en trois dimensions en anatomie. L'objectif n'est pas de montrer la supériorité d'une méthode en particulier, mais de comprendre l'intérêt porté aux modélisations en trois dimensions dans l'enseignement de l'anatomie. Ensuite, des rappels anatomiques portant sur le muscle et sur les structures nécessaires à la compréhension de la région étudiée seront effectués, avant de s'intéresser au travail expérimental de cette thèse : les dissections. Une dernière partie présentera les résultats obtenus avec le recueil des insertions musculaires et l'élaboration des fiches pédagogiques qui seront utilisées pour élaborer le logiciel. La totalité des fiches effectuées figureront parmi les annexes de cette thèse.
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L'anatomie comparée des différentes espèces domestiques est une science à laquelle ne peut échapper aucun docteur vétérinaire. De nos jours, l'apprentissage de cette science peut passer par l'utilisation de nombreux outils. Les logiciels représentant l'anatomie des espèces domestiques en trois dimensions sont un outil pratique, rapide et efficace afin d'optimiser la qualité de l'apprentissage. Cette thèse a pour objet de s'intégrer dans un projet de logiciel d'anatomie canine tridimensionnelle qui se veut à la fois dynamique, intuitif, précis et ludique : AnatoPlus. Les données d'ostéologie ont été collectées lors d'une précédente thèse d'exercice vétérinaire soutenue par Lucie Guyon en 2015. Deux ans plus tard, l'objectif est d'apporter le maximum de données scientifiques et graphiques sur les muscles du cou, du tronc et de la queue du Chien. Ces données seront conjointement associées aux résultats de trois autres thèses qui viendront compléter la représentation en trois dimensions de la myologie canine. La première partie de la présente thèse présentera globalement le projet AnatoPlus, elle posera également les bases fondamentales de l'ostéologie et de la myologie des régions étudiées. Ensuite, dans une seconde partie, seront développés le matériel et les méthodes utilisés afin de fournir les informations nécessaires à la progression du projet. La troisième partie exposera les résultats obtenus, à savoir, les tableaux descriptifs de chaque muscle ou groupe musculaire, les légendes des photographies de dissection, le recensement et les légendes des insertions musculaires os par os. Enfin, nous mettrons en lumière les points discutables et les limites atteintes.
[-] L'anatomie comparée des différentes espèces domestiques est une science à laquelle ne peut échapper aucun docteur vétérinaire. De nos jours, l'apprentissage de cette science peut passer par l'utilisation de nombreux outils. Les logiciels représentant l'anatomie des espèces domestiques en trois dimensions sont un outil pratique, rapide et efficace afin d'optimiser la qualité de l'apprentissage. Cette thèse a pour objet de s'intégrer dans un ...
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Dans le cadre de l'informatisation des milieux d'élevage, et devant l'absence d'analyse des données de l'élevage de Tursiops truncatus du delphinarium du parc Astérix, nous avons réalisé un logiciel permettant d'améliorer la gestion de la maintenance en delphinarium du Tursiops truncatus et d'Otaria bryonia. Le but de cette étude est de présenter la méthode de développement structurée d'un logiciel dans une entreprise pour la maintenance d'animaux marins (déterminer les points clés de surveillance pour l'espèce considérée), comprenant ensuite la réalisation d'un cahier des charges (analyse du fonctionnement du Delphinarium et de l'existant, spécifications fonctionnelles et techniques) et création du logiciel, réalisation de tests, installation et rédaction d'un guide de l'utilisateur. Ce logiciel a été réalisé en collaboration avec les soigneurs du delphinarium du parc Astérix à l'aide du logiciel de base de données AccessTM 2002. Le résultat est présenté sous forme des spécifications fonctionnelles et techniques du logiciel, d'un organigramme du logiciel et du guide de l'utilisateur. Cet outil comporte plus de 300 données structurées et exploitables et une interface d'exploitation (95 graphiques et 170 requêtes triant les données). Il permet une meilleure communication afin d'accélérer la prise des décisions en ce qui concerne la santé et l'apprentissage des animaux. Le logiciel aujourd'hui en cours de tests terminaux pourrait permettre de donner naissance à d'autres études, (recherche de corrélations diverses notamment en ce qui concerne la physiologie et pathologie du dauphin) Il pourrait également être utilisé dans d'autres delphinariums dans le monde. Mots clés : logiciel/informatique/base de données/élevage/delphinarium/cétacé/dauphin/otarie
[-] Dans le cadre de l'informatisation des milieux d'élevage, et devant l'absence d'analyse des données de l'élevage de Tursiops truncatus du delphinarium du parc Astérix, nous avons réalisé un logiciel permettant d'améliorer la gestion de la maintenance en delphinarium du Tursiops truncatus et d'Otaria bryonia. Le but de cette étude est de présenter la méthode de développement structurée d'un logiciel dans une entreprise pour la maintenance ...
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