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Ce travail vise à définir la notion d'hypertypes chez le chien, en particulier les hypertypes comportementaux. En effet, si les hypertypes canins sont souvent étudiés d'un point de vue morphologique, l'aspect comportemental reste très peu évoqué, sans définition proposée. Ainsi, à travers une étude bibliographique, nous expliquons que le comportement possède une composante génétique mais également qu'il peut être sélectionné. Nous avons ainsi étudié de plus près les méthodes de sélection (en étudiant les standards et compétitions auxquels les chiens sont soumis). L'étude des standards nous a mené à la production d'une annexe d'origine bibliographique regroupant les caractéristiques comportementales des races soumises à épreuve de travail. Nous avons de plus précisé la définition actuelle de l'hypertype morphologique, afin de transposer cette définition à l'hypertype comportemental. Cette démarche nous a mené à proposer la définition suivante pour l'hypertype comportemental : « expression extrême de caractères comportementaux distinctifs propres à certaines races, pouvant impacter leur bien-être lorsqu'elle devient inadaptée au milieu ». La recherche bibliographique nous incite à envisager des conséquences impactant le bien-être des chiens à hypertype comportemental. Ainsi, nous avons étudié les troubles comportementaux qui semblent le plus en relation avec les hypertypes comportementaux.
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Ce travail vise à définir la notion d'hypertypes chez le chien, en particulier les hypertypes comportementaux. En effet, si les hypertypes canins sont souvent étudiés d'un point de vue morphologique, l'aspect comportemental reste très peu évoqué, sans définition proposée. Ainsi, à travers une étude bibliographique, nous expliquons que le comportement possède une composante génétique mais également qu'il peut être sélectionné. Nous avons ainsi ...
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Cette thèse examine le lien entre la morphologie des jeunes chevaux de race Arabe ou croisés Arabe avec leur performance et leur longévité de carrière en course d'endurance. L'objectif est d'identifier des associations significatives entre la morphologie au jeune âge et les résultats sportifs ultérieurs, afin d'identifier des critères morphologiques spécifiques qui pourraient être utilisés pour la sélection génétique. Les données morphologiques ont été recueillies sur un échantillon de 489 chevaux Arabes ou croisés Arabes, âgés de quatre à six ans, entre 2011 et 2014, dans des conditions répétables. Elles incluent des mesures morphologiques directes et morphométriques - longueurs, angles et inclinaisons des rayons osseux - évaluées sur une photographie de profil. Ces caractères sont comparés aux performances des chevaux en compétition d'endurance à travers la valeur de leurs indices de performance en endurance (IRE) attribués par l'INRAE, de leur participation à des courses d'endurance de haut niveau, et de leur longévité de carrière. En raison du grand nombre de critères étudiés, la significativité des résultats statistiques obtenus n'est pas fiable. Cette étude ne peut donc être considérée que comme exploratoire et ses conclusions devront être validées par des études complémentaires. Quelques variables morphologiques apparaissent faiblement corrélées à la performance. Les variables illustrant un grand format semblent corrélées à de meilleurs indices de performance, mais apparaissent en défaveur d'une carrière longue. Une sélection exclusivement basée sur des critères morphologiques ne semble pas pertinente au vu des faibles corrélations observées. Il semblerait plus approprié d'analyser la performance en incluant d'autres facteurs physiologiques intrinsèques avant d'établir un programme de sélection génétique. La longévité de carrière semble être un critère d'étude essentiel à inclure dans ce type d'étude afin de vérifier que la sélection en faveur de la performance n'est pas antagoniste avec la capacité à concourir sur du long terme.
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Cette thèse examine le lien entre la morphologie des jeunes chevaux de race Arabe ou croisés Arabe avec leur performance et leur longévité de carrière en course d'endurance. L'objectif est d'identifier des associations significatives entre la morphologie au jeune âge et les résultats sportifs ultérieurs, afin d'identifier des critères morphologiques spécifiques qui pourraient être utilisés pour la sélection génétique. Les données morphologiques ...
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Le développement effréné de résistances aux anthelminthiques constaté chez Haemonchus contortus amène à réfléchir à de nouveaux moyens de lutte, notamment la voie génétique. La création de lignées divergentes vis-à-vis de la résistance à Haemonchus contortus permet de caractériser les mécanismes de cette sélection et ses effets, plus particulièrement sur les caractères de production. Des agnelles issues de lignées divergentes ont ainsi été intégré dans un protocole d'infestation expérimentale. Les animaux ont été réparti en lots résistant/sensible (R/S) et infestés/témoins (INF/TEM). Des paramètres de production (poids, épaisseur en gras dorsal, épaisseur en muscle dorsal), d'infestation (OPG, hématocrite, charge parasitaire), et de profil immunitaire (numération des leucocytes) ont été mesuré tout au long du protocole. Il apparaît que la sélection amène à une excrétion d'oeufs bien moindre, associée à des niveaux d'hématocrite, d'épaisseur de muscle dorsal, et de poids supérieurs chez les agnelles INF-R par rapport aux agnelles INF-S. Par ailleurs, les agnelles de lignée R accumulent moins de gras dorsal indépendamment de l'infestation. Les mesures de charge parasitaire suggèrent des niveaux d'infestation moindre chez les agnelles de lignée R à J31 post infestation. Les résultats concernant les lignée immunitaires révèlent une baisse des numérations en leucocytes totaux et lymphocytes associée à l'infestation, toutefois moins marquée dans la lignée R. Ces résultats permettent de mieux appréhender les mécanismes et effets de la sélection.
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Le développement effréné de résistances aux anthelminthiques constaté chez Haemonchus contortus amène à réfléchir à de nouveaux moyens de lutte, notamment la voie génétique. La création de lignées divergentes vis-à-vis de la résistance à Haemonchus contortus permet de caractériser les mécanismes de cette sélection et ses effets, plus particulièrement sur les caractères de production. Des agnelles issues de lignées divergentes ont ainsi été ...
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Le colley à poil court est un chien de berger anglais qui a été fixé et développé en tant que race à la fin du XIXe siècle. Il s'agit d'une race distincte du colley à poil long, sauf en Amérique du Nord. C'est un chien de compagnie polyvalent qui a de bonnes aptitudes au travail. Des maladies héréditaires sont transmises dans les lignées, parmi lesquelles on peut citer la mutation du gène MDR1, l'anomalie de l'oeil du colley, la dysplasie coxo-fémorale, la myélopathie dégénérative, la dermatomyosite familiale canine ou la neutropénie cyclique canine. Les différents acteurs cynophiles impliqués dans l'amélioration de la race élaborent des stratégies d'éradication de certaines de ces maladies qui reposent sur la sélection des reproducteurs faite par les éleveurs. Nous avons réalisé des enquêtes à destination des éleveurs et propriétaires de la race, dont les réponses ont permis de mieux comprendre comment sont élevés les colleys à poil court et par qui à travers le monde, qui sont leurs propriétaires et comment ils s'en occupent.
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Le colley à poil court est un chien de berger anglais qui a été fixé et développé en tant que race à la fin du XIXe siècle. Il s'agit d'une race distincte du colley à poil long, sauf en Amérique du Nord. C'est un chien de compagnie polyvalent qui a de bonnes aptitudes au travail. Des maladies héréditaires sont transmises dans les lignées, parmi lesquelles on peut citer la mutation du gène MDR1, l'anomalie de l'oeil du colley, la dysplasie ...
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Depuis la domestication, le nombre de races de chiens n'a cessé d'augmenter afin de répondre à des tâches précises. Depuis le XIXe siècle, la cynophilie s'est énormément développée, d'abord en Angleterre, puis partout dans le monde. Des instances cynophiles ont ainsi vu le jour dans différents pays entre la fin du XIXe et le début du XXe siècle, garantes de la pérennité du chien de race. Parmi ces instances, la FCI est celle regroupant le plus de pays. Elle est chargée de la tenue des pedigrees et des standards de races pour les 98 pays membres. Ces standards sont la description de l'archétype d'une race, le modèle idéal. Ils sont standardisés pour les 356 races reconnues par la FCI (au 21 juin 2022) et revêtent un vocabulaire spécifique. Ce travail a permis la réalisation d'un fichier pdf contenant un lexique de 121 termes anatomiques présents dans ces standards. Chaque page correspond à un terme et sur celle-ci, figure la définition selon Raymond Triquet, les races dont le standard utilise ce terme et celles pour lesquelles le caractère est considéré comme un défaut dans la race. Ce lexique est destiné principalement aux juges de la FCI et aux éleveurs, mais peut aussi être utilisé par des particuliers. Il est toutefois figé à instant donné puisque non modifiable sous sa forme actuelle.
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Depuis la domestication, le nombre de races de chiens n'a cessé d'augmenter afin de répondre à des tâches précises. Depuis le XIXe siècle, la cynophilie s'est énormément développée, d'abord en Angleterre, puis partout dans le monde. Des instances cynophiles ont ainsi vu le jour dans différents pays entre la fin du XIXe et le début du XXe siècle, garantes de la pérennité du chien de race. Parmi ces instances, la FCI est celle regroupant le plus ...
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Après avoir présenté les caractéristiques générales, biologiques et comportementales du moineau domestique (Passer domesticus), cette thèse décrit, à partir d'une compilation des publications scientifiques, l'impact des différentes caractéristiques du milieu urbain sur les oiseaux en choisissant comme fil rouge, le moineau domestique. Le moineau domestique est un passereau anthropophile qui possède des particularités faisant de lui un oiseau synurbique adapté au milieu urbain. Sa population a décliné depuis les années 1970 dans tous les environnements des pays qu'il avait colonisés avant le Xxesiècle. Bien que synurbique, le moineau domestique semble impacté par le milieu urbain, notamment au niveau de ses caractéristiques morphologiques et de son succès reproducteur. A l'échelle d'une ville, les ressources pour nidifier sont généralement suffisantes pour les espèces cavernicoles ou arboricoles. Il en est de même pour les ressources alimentaires. Ces ressources sont cependant inégalement réparties, entraînant des concentrations des populations d'oiseaux qui entrent alors en compétition.Les déchets anthropiques et les nourrissages permettent aux oiseaux de subvenir à leurs besoins alimentaires mais leurs qualités nutritionnelles particulières contribuent parfois à modifier certaines de leurs fonctions biologiques.Le milieu urbain possède des caractéristiques physico-chimiques différentes de celles du milieu rural (température plus élevée, champs électromagnétiques, éclairage nocturne, bruit, pollution). Ces paramètres sont souvent sources d'inexorables modifications biologiques, comportementales et démographiques chez les oiseaux. Cependant quelques espèces, comme le moineau domestique, y font face en parvenant à s'adapter. Les oiseaux doivent cohabiter avec d'autres êtres vivants dans ce milieu artificialisé, au premier rang desquels les humains. La cohabitation avec ces derniers est facilitée par la sélection des oiseaux les moins farouches. De plus, les oiseaux sont relativement moins exposés aux prédateurs dans le milieu urbain. En fonction de la ville, les oiseaux urbains peuvent être plus ou moins exposés à des agents pathogènes qui peuvent constituer une menace d'autant plus lorsqu'il s'agit d'agents émergents.
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Après avoir présenté les caractéristiques générales, biologiques et comportementales du moineau domestique (Passer domesticus), cette thèse décrit, à partir d'une compilation des publications scientifiques, l'impact des différentes caractéristiques du milieu urbain sur les oiseaux en choisissant comme fil rouge, le moineau domestique. Le moineau domestique est un passereau anthropophile qui possède des particularités faisant de lui un oiseau ...
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La dermatophytose ovine est une mycose cutanée infectieuse et contagieuse, peu documentée, mais dont les impacts économiques et de santé publique lui méritent d'être davantage étudiée. Sur la base des connaissances actuelles concernant les dermatophytoses des ruminants, deux lots comptant chacun une centaine de béliers de sélection de race solognote ont été consécutivement pris en charge, dans l'objectif de prévenir ou, le cas échéant, de lutter contre la dermatophytose ovine. Le centre de sélection étudié était infecté de façon récurrente par la dermatophytose. En intégrant les problématiques liées à la race solognote et au fonctionnement d'un organisme de sélection ovine, un premier lot infecté a été pris en charge pour diagnostic clinique et expérimental, audit d'élevage et délivrance de conseils en termes de thérapeutique et de prophylaxie vaccinale. Un second lot est pris en charge l'année suivante. Un plan de prévention de la dermatophytose est conçu en amont de l'arrivée des animaux au centre, instant auquel un bilan de santé du troupeau est dressé. Un protocole vaccinal à l'aide d'un vaccin vivant atténué est mis en place. Suite au protocole vaccinal, la dermatophytose est à nouveau diagnostiquée cliniquement et biologiquement. Un suivi clinique de la dermatophytose, un audit d'élevage et une prise en charge des problématiques sanitaires concomitantes sont réalisés. Différents traitements locaux ainsi que des mesures de prophylaxie sanitaire sont également mis en oeuvre. L'analyse descriptive des lésions de dermatophytose a permis de les caractériser, de révéler leur diversité, de proposer un système de scoring clinique, et de confronter ces observations cliniques aux résultats des examens biologiques et aux mesures de lutte mises en oeuvre. Les diagnostics expérimentaux révèlent une infection par le dermatophyte T. verrucosum. Le suivi de santé du troupeau et l'audit d'élevage associé ont permis la recherche voire l'identification de plusieurs facteurs de risque de dermatophytose, tels qu'une perte rapide d'état corporel. Dans les deux lots, les résultats associés aux thérapies médicales conventionnelles ou alternatives ont été peu concluants. À l'inverse, une prophylaxie médicale correctement menée, et associée à la maîtrise des facteurs de risque de dermatophytose, semble prometteuse. Un lot de 91 béliers cliniquement exempts de dermatophytose et en très bon état général a ainsi été mis à la vente en juin 2021. En conclusion, il semble qu'une approche de médecine collective, alliant prophylaxie médicale, prophylaxie sanitaire et maîtrise des facteurs de risque, représente une méthode de lutte efficace contre la dermatophytose ovine.
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La dermatophytose ovine est une mycose cutanée infectieuse et contagieuse, peu documentée, mais dont les impacts économiques et de santé publique lui méritent d'être davantage étudiée. Sur la base des connaissances actuelles concernant les dermatophytoses des ruminants, deux lots comptant chacun une centaine de béliers de sélection de race solognote ont été consécutivement pris en charge, dans l'objectif de prévenir ou, le cas échéant, de lutter ...
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Les questionnaires et les tests de mise en situation permettent la caractérisation et l'évaluation du tempérament des animaux domestiques. Le but de cette thèse est de faire une revue bibliographique des tests et questionnaires de tempérament existant pour trois espèces domestiques qui ont une relation particulière avec l'Homme - le chien, le chat et le cheval - afin d'en comparer les avantages et les limites, et de présenter les traits de tempérament évalués par chacun. Pour le chien, cette revue présente en détails des tests tels que le « Dog Mentality Assessment », le test de « Netto et Planta » et des questionnaires tels que le « Monash Canine Personality Questionnaire » et le « Canine-Behavioral Assessment and Research Questionnaire ». D'autres études présentant les traits de tempérament du chien et leur évaluation sont présentées dans un tableau récapitulatif. Chez le chat, le test de tempérament présenté en détail est le plus ancien, le « Feline Temperament Profile ». Les questionnaires développés sont le « Feline-Behavioral Assessment and Research Questionnaire » et le « Feline Five » plus simples à utiliser. Concernant le cheval, les questionnaires détaillés sont le « Horse Personality Questionnaire » et le questionnaire de Momozawa et al.. Les tests de mise en situation, tels que le test de Lansade et les tests de tempérament simplifiés sont les plus utilisés. La littérature scientifique propose un grand nombre de tests d'évaluation du tempérament et expose la nécessité de standardiser les méthodes pour les rendre plus performants. Leurs applications sont nombreuses, notamment pour la sélection d'individus et de reproducteurs aux phénotypes comportementaux mieux adaptés à la vie avec l'humain, et aux tâches pour lesquelles ces animaux sont choisis.
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Les questionnaires et les tests de mise en situation permettent la caractérisation et l'évaluation du tempérament des animaux domestiques. Le but de cette thèse est de faire une revue bibliographique des tests et questionnaires de tempérament existant pour trois espèces domestiques qui ont une relation particulière avec l'Homme - le chien, le chat et le cheval - afin d'en comparer les avantages et les limites, et de présenter les traits de ...
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Actuellement, les conditions de culture in vitro et les méthodes de sélection et de transfert embryonnaire ne permettent qu'à peu d'embryons bovins produits in vitro de donner naissance à un veau sain. Un des leviers pour améliorer ces faibles rendements est une meilleure sélection des embryons à transférer. Les systèmes time-lapses permettent désormais d'obtenir des informations morphocinétiques sur le développement embryonnaire in vitro et pourrait permettre de mieux sélectionner ces embryons. L'objectif de cette thèse a été de tester la validité d'une nouvelle classification des embryons produits in vitro à partir de critères morphocinétiques sur un faible effectif de transferts embryonnaires. Pour ce faire, 27 embryons produits in vitro ont été classés selon ces nouveaux critères et transférés chez des receveuses. Une étude comparative du déroulement des gestations obtenues à partir d'embryons classés dans les catégories A « éclosion précoce », B « éclos », C « blastocyste retardé » et D « arythmiques » a alors été réalisée grâce des dosages de progestérone et un suivi échographique. Les résultats obtenus suggèrent que les embryons de la catégorie A sont bien les plus intéressant à transférer puisqu'ils ont donné le meilleur taux de naissance (66,7%) avec uniquement les pertes causées par la mortalité embryonnaire précoce. La catégorie D est également intéressant puisqu'elle obtient 25% de naissance mais avec une majorité de pertes tardives à très tardives. Il n'est donc économiquement pas conseillé de transférer cette catégorie, cependant, il serait intéressant de connaitre la cause de ces pertes tardives. Nous avons observé un avorton et un veau mort-né qui pourrait avoir subi un Large Offspring Syndrome. Bien que testé sur un petit effectif, cette classification semble déjà efficace pour distinguer la catégorie avec le plus de chance de générer une naissance et celle avec plus de chances de générer des pertes en fin de gestation. Tester cette classification à plus grande échelle est donc la prochaine étape de ce projet.
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Actuellement, les conditions de culture in vitro et les méthodes de sélection et de transfert embryonnaire ne permettent qu'à peu d'embryons bovins produits in vitro de donner naissance à un veau sain. Un des leviers pour améliorer ces faibles rendements est une meilleure sélection des embryons à transférer. Les systèmes time-lapses permettent désormais d'obtenir des informations morphocinétiques sur le développement embryonnaire in vitro et ...
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