Les cryptosporidioses sont des maladies parasitaires zoonotiques d'importance majeure en santé humaine comme en santé animale. Elles sont à l'origine de pertes économiques majeures en élevage. La découverte d'un symbionte viral chez Cryptosporidium, nommé Cryspovirus, a rebattu les cartes de la compréhension de la pathogénie et de l'épidémiologie de ce parasite. L'objet de ce travail était, après une étude bibliographique retraçant les principales caractéristiques de C. parvum et de Cryspovirus, de mettre en évidence la présence de CSpV-1 dans des échantillons de matières fécales recueillis sur le terrain ainsi qu'une analyse épidémiologique des clades de Cryspovirus circulant chez l'homme et les ruminants en France. Ce travail a conduit à la réalisation de plusieurs PCR sur des échantillons collectés sur le terrain dans des élevages ovins et bovins ainsi que sur des échantillons d'origine humaine fournis par le Centre national de référence des cryptosporidies du CHU de Rouen. L'objectif était dans un premier temps de confirmer la présence d'une cryptosporidie dans l'échantillon puis de tester la présence des ARN viraux et enfin de les séquencer. Nous avons montré que le Cryspovirus est très répandu parmi les lignées de cryptosporidies en France, et ce dans plusieurs espèces (humain, ovin, bovin). Il s'agit de la première description du Cryspovirus en France dans des lignées de Cryptosporidium isolées chez l'être humain. Ce Cryspovirus est un virus à ARN qui présente un mode de transmission tout à fait original, par voie verticale exclusivement. La présence de ce virus dans les cryptosporidies semble être à l'origine d'une fécondité et d'une infectiosité majorée, sans que le mode d'action précis ne soit pour l'instant clairement identifié. L'hypothèse la plus probable est une action du virus sur la voie de l'interféron gamma chez l'hôte mammifère qui permet au parasite d'échapper au système immunitaire. La prévalence observée de CSpV-1 au cours des manipulations était de près de 85% toutes espèces confondues. De nouvelles expériences doivent maintenant être entreprises sur cultures cellulaires afin de quantifier précisément l'effet de l'infection de Cryptosporidium par Cryspovirus.[-]