Quelques études basées sur le séquençage ARN (RNAseq) ont rapporté des similarités potentielles entre les carcinomes épidermoïdes oraux (OSCC) canins et humains, dont le processus de Transition Epithélio-Mésenchymateuse (TEM). La TEM met en jeu les facteurs de transcription (FT) majeurs SNAI1/2, TWIST1 et ZEB1/2, avec des données contradictoires quant à leur importance relative. L'objectif principal de notre étude était d'investiguer la régulation de la TEM par ces cinq FT dans les OSCC humains et canins, à travers l'analyse de données RNAseq ‘bulk' et ‘single-cell'. Un second aspect de notre projet était d'évaluer une procédure pour isoler des cellules uniques à partir d'échantillons FFPE d'OSCC, avec l'objectif à long terme de réaliser du RNAseq ‘single-cell'. Notre étude a confirmé la présence d'une forte signature TEM dans les OSCC. A l'échelle de la tumeur, la signature TEM corrélait avec l'expression de l'ensemble des FT étudiés. Dans les données humaines, la pureté des échantillons était un facteur de confusion potentiel pour l'étude de la TEM, mais n'expliquait pas l'ensemble des variations observées. A l'échelle de la cellule unique, SNAI2 était surexprimé dans des sous-populations de cellules malignes humaines avec des caractéristiques plus mésenchymateuses et/ou moins épithéliales. L'implication des autres FT ne pouvait être exclue. Enfin nous avons généré des suspensions cellulaires à partir d'échantillons FFPE d'OSCC canins. En résumé, nos données soulignent des similarités entre OSCC humains et canins vis-à-vis de la TEM, ainsi que l'importance de prendre en considération l'hétérogénéité inter- et intra-tumorale pour l'étude de processus comme la TEM.[-]