A l'oree de ce vingt et unieme siecle debutant, les trypanosomoses animales demeurent encore un des principaux facteurs limitant le developpement economique de l'Afrique intertropicale. La lutte contre la maladie est tres dependante de methodes diagnostiques fiables. L'amplification en chaine par polymerase ou PCR est une technique de biologie moleculaire alliant une bonne sensibilite (1 a 2 trypanosomes par millilitre de sang) et une excellente specificite. Ce travail presente d'abord une synthese des principaux apports de la pcr pour le diagnostic des trypanosomoses animales africaines et tente de montrer en quoi cette technique a contribue a mieux comprendre l'epidemiologie de la maladie. Dans une seconde partie, cette importante contribution est illustree par une application de la entomologiques de terrain, menees sur l'hote ruminant comme sur les vecteurs, dans deux pays d'Afrique de l'ouest, le Burkina Faso et la Cote d'Ivoire.