Afin d'explorer l'influence des antibiotiques utilisés en aquaculture piscicole salmonicole sur les communautés bactériennes de l'environnement aquatique, notamment en terme d'antibiorésistance acquise, l'usage de dispositifs de type écosystème expérimental est envisagé. Le concept est présenté de façon théorique puis dans ses aspects pratiques. Ensuite sont recensés les différents xénobiotiques affectant le milieu aquatique avant que l'attention ne se concentre sur les antibiotiques pour enfin proposer un protocole d'étude.