Le diagnostic des entérites chroniques idiopathiques (ECI) du chien est un diagnostic d'exclusion qui est conditionné par la réalisation de biopsies intestinales permettant l'identification d'une infiltration inflammatoire chronique de la muqueuse. En pratique, l'endoscopie duodénale est la méthode de choix pour réaliser les biopsies. Une étude rétrospective a été menée sur 13 chiens atteints d'ECI et 7 chiens sains. L'intensité des modifications histologiques a été comparée dans les trois segments de l'intestin grêle (duodénum, jéjunum et iléon). Cette étude montre que l'histologie duodénale ne permet pas de prédire l'intensité des lésions présentes sur les deux autres segments de l'intestin grêle. C'est pourquoi chez les chiens suspects d'ECI, il est préférable de prélever à minima les deux portions de l'intestin grêle accessibles à l'endoscopie : le duodénum et l'iléon.