Le faible effectif des colonies françaises de phoque gris et de phoque veau marin rend ces espèces vulnérables et à haute valeur patrimoniale. Aussi, de nombreuses menaces pèsent sur elles, mais aucune étude française n'a encore évalué les risques infectieux liés aux Morbillivirus et aux bactéries des genres Brucella et Leptospira.

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