De janvier 2004 à mai 2005, des analyses bactérioscopiques, sérologiques et PCR pour Chlamydia spp., Coxiella burnetii (fièvre Q) et Toxoplasma gondii ont été réalisées au LVD79 lors de 102 déclarations d'avortements ovins (41) et caprins (61). Leur concordance a été évaluée par maladie et par espèce grâce au test exact de Fischer. C. spp apparaît comme le principal agent abortif ovin. C. burnetii a été retrouvé à un faible niveau chez les ovins (uniquement par PCR). Par contre, il représente l'agent abortif prédominant chez les caprins. La concordance entre bactérioscopie et PCR est bonne chez les caprins lors de recherche de C.burnetii ou de C.spp. Enfin, le nombre de résultats PCR positifs pour la toxoplasmose confirme que la PCR est un précieux outil de diagnostis, correctement lié à la sérologie chez les caprins (bonne concordance entre sérologie et PCR), ainsi que chez les les ovins dans certaines conditions (prélèvements sanguins élevés et travail sur avorton pour la PCR).