L'influenza aviaire est défini par le Code Zoosanitaire de l'OIE comme "une infection des volailles causées par tout virus influenza de type A répondant aux critères de pathogénicité reconnus internationalement". Parmi les réservoirs qui peuvent être à l'origine de la diffusion d'un virus hautement pathogène vers les populations d'oiseaux domestiques, les oiseaux d'eau sont ceux qui sont le plus souvent évoqués. Plus particulièrement, le Colvert semble tenir une place essentielle dans l'épidémiologie des virus influenza A ; nous nous sommes interrogés sur le rôle que pourrait jouer l'espèce en Dombes. Notre travail constitue une étude épidémiologie descriptive des virus influenza A dans les populations d'anatinés de la Dombes. Il s'agit d'une analyse de la circulation virale dans une région potentiellement à risque pour la survenue d'épizootie d'influenza aviaire hautement pathogène. En février 2006, alors que nous poursuivions notre travail de terrain, la Dombes a constitué l'extrémité occidentale d'un foyer H5N1 européen. Afin d'avoir une meilleure vision des modes de circulation virale, nous avons compléter le travail de "surveillance active" par une analyse épidémiologique descriptive de ce foyer. Ainsi, nous avons constaté la faible probabilité d'une circulation de virus H5N1 dans l'avifaune sauvage avant février 2006. En revanche, l'étude de "surveillance active" a donné lieu à l'isolement d'autres souches faiblement pathogènes dont le mode de circulation et les liens devront être éclaircis ultérieurement. D'autre part, l'analyse des données obtenues dans le cadre du suivi du foyer H5N1 de février 2006 a révélé le caractère limité de son extension géographique et de sa persistance.

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