Les ressources en eau devront être une préoccupation majeure dans les décennies à venir, notamment concernant les besoins en eau potable. La gestion de cette ressource passe nécessairement par la protection de tous les milieux aquatiques. Le fonctionnement de ceux-ci garantissant la qualité de la ressource. Des mesures de protection forte doivent donc être prises en faveur de ces milieux. Cela passe par la mise en place de moyen d’évaluation mais aussi de surveillance des milieux aquatiques. Cette surveillance portant à la fois sur des aspects physico-chimiques et sur des aspects biologiques. Pour cela, des indicateurs biologiques ont été élaborés depuis de nombreuses années. La Directive Cadre Européenne sur l'eau, du fait de ces exigences en matière de bioindication à donné un nouvel élan à ces recherches, conduisant à la mise en place d’outils de plus en plus performants, permettant d’ajuster au mieux les actions de protection et de restauration nécessaires.