Blastocystis sp. est un protozoaire qui fait parti des straménopliles. C’est un parasite commun du tube digestif de l’homme et des animaux, dont les sous-types identifiés varient selon les espèces. Dans l’espèce humaine il a été identifié comme responsable de troubles digestifs, notamment des diarrhées chroniques chez des sujets immunodéprimés, il est très souvent associé à d’autres pathogènes entériques. Son étude s’est jusqu’alors essentiellement concentrée sur l’espèce humaine. Son cycle et sa pathogénie restent cependant mal connus. Sa diversité génétique est grande et son potentiel zoonosique inquiète. Dans cette étude réalisée sur 113 chiens, une prévalence de 3.5% a été obtenue après analyse génétique. Deux sous-types ont pu être mis en évidence, les sous-types 2 et 10, en proportion égale. Aucun lien significatif n’a pu être mis en évidence avec la présence de symptômes digestifs, l’association d’autres pathogènes ou encore l’âge et le sexe des animaux étudiés. Sa prévalence chez le chien est décrite pour la première fois en France, elle semble faible, mais cette étude ne s’intéresse qu’à une infime sous population.