La coproculture est un examen complémentaire délicat à interpréter pour le praticien vétérinaire dans le cadre de l'investigation d'une diarrhée survenant chez le chien et le chat. L'objectif de ce manuscrit est de replacer la coproculture dans la démarche diagnostique des diarrhées d'origine bactérienne du chien et du chat mais aussi de préciser les conditions techniques de réalisation de cet examen. Il s'attache également à aider tout praticien dans l'interprétation des résultats transmis par le laboratoire. Premièrement, le choix de réaliser une coproculture se fait selon des contextes épidémio-cliniques propres à chaque germe suspecté mais aussi lorsque l'on se trouve dans un contexte plus général tel que : diarrhée contagieuse dans un effectif, diarrhée aiguë hémorragique avec répercussions sur l'état général non due à un parvovirus, diarrhée chronique rebelle à tout traitement, suspicion de zoonose ou diarrhée nosocomiale. Deuxièmement, le prélèvement de selles doit être le plus minutieux possible, être conditionné dans un milieu de transport adapté et envoyé au laboratoire dans les 24 à 48 heures sous couvert du froid. Enfin, le résultat fourni par le laboratoire doit toujours être interprété à la lueur du contexte clinique dans lequel se trouve l'animal. Par ailleurs, la coproculture doit le plus souvent être complétée par d'autres examens, notamment immuno-enzymatiques (recherche de toxines pour Clostridium spp. et E.coli) et moléculaires (recherche des gènes "facteurs de virulence" pour E.coli, des gènes codant pour les toxines, ou du matériel génétique bactérien (Salmonella spp. et Campylobacter spp.). Cela permettra de caractériser davantage le caractère virulent des bactéries isolées.