Le règlement (CE) N°1099/2009 sur la protection des animaux au moment de leur mise à mort a changé profondément la manière de travailler des professionnels de l’abattage et des services vétérinaires en matière de bien-être animal. Après avoir retracé l’historique de la protection animale en Europe et en France et l’apparition de la notion de bien-être animal, les nouveautés apportées par le règlement N°1099/2009, de par la responsabilisation des professionnels, ont été développées. L’objectif de cette thèse a été d’étudier la mise en place et l’appropriation par les professionnels de ces nouvelles normes à travers une étude de l’ANSES et des stages en abattoirs. Dans un contexte où le contrôle de la protection animale en abattoir est actuellement sujet à de vifs débats en France, les perspectives de cette remise en question sont abordées.