L’Agalactie Contagieuse ovine due à Mycoplasma agalactiae sévit au Pays Basque de façon enzootique. Son incidence est aujourd’hui proche de zéro, mais sa prévalence diminue peu. La prophylaxie sanitaire mise en place par le Groupement de Défense Sanitaire, en partenariat avec le Laboratoire des Pyrénées et des Landes (LPL) repose du point de vue analytique sur la détection des troupeaux infectés par PCR appliquée au lait de tank et, secondairement, par sérologie Elisa.Le premier volet de la présente étude évalue la répétabilité et la reproductibilité de la PCR en temps réel, récemment proposée par le LPL, lorsqu’elle est appliquée à des laits de grand volume (tanks). Les variances de reproductibilités obtenues amènent à proposer la mise en place d’une étude de plus grande ampleur, et éventuellement d’optimiser la concentration des mycoplasmes dans les volumes de lait. Le second volet décrit un protocole d’assainissement par abattage partiel mis en place pour l’Agalactie. La négativation des troupeaux suivis a été obtenue (et conservée) après réforme des brebis positives. Il convient cependant de poursuivre le suivi de ces troupeaux et, pour l’avenir, de mieux connaître la valeur prédictive de la sérologie Elisa par rapport à l’excrétion.