Les cryptosporidioses sont causées par des protozoaires des coccidies du genre cryptosporidium qui parasitent les microvillosités des cellules épithéliales des appareils digestif et respiratoire des vertébrés. Chez les oiseaux, deux espèces sont décrites : cryptosporidium baileyi et cryptosporidium meleagridis. Des infections naturelles ont été rapportées chez de nombreuses espèces d'oiseaux. Les cryptosporidies ont d'abord été considérées comme des parasites commensaux, mais sont désormais connues comme des parasites pathogènes primaires. Cryptosporidium meleagridis, localisé dans l'intestin grêle est responsable de troubles digestifs de nature diarrhéique. Cryptosporidium baileyi se développe dans l'appareil respiratoire et la bourse de fabricius, causant de graves troubles respiratoires. Actuellement, il n'existe pas de médicaments préventifs ou curatifs des infections cryptosporidiennes. La prophylaxie sanitaire apparaît donc comme le seul moyen de contrôler les cryptosporidioses aviaires. L'impact sanitaire et économique de l'infection par cryptosporidium sur la filière avicole est méconnu et mérite d'être étudié de manière approfondie.