Après une synthèse des principaux agents pathogènes en conchyliculture, l'auteur présente le protozoaire Marteilia refringens, parasite majeur de l'huître plate Ostrea edulis en Europe, dont le cycle reste inconnu. Suit une étude expérimentale de la dynamique du parasite dans l'huître, intégrée à un modèle d'étude de la marteiliose en claire ostréicole, montrant l'existence d'une fenêtre temporelle d'infection et aboutissant à une nouvelle hypothèse de cycle parasitaire. Ces résultats sont enfin mis en relation avec la détection récente de Marteilia refringens dans le copépode Acartia grani, hôte intermédiaire potentiel.