De par sa position de référent en matière de santé animale, le vétérinaire libéral peut être amené à intervenir au sein des établissements de vente et de transit d'animaux de compagnie tels que les animaleries commerciales. A l'image des poissons tropicaux d'ornement, la nature même des nouveaux animaux de compagnie proposés à la vente, dont une majorité d'espèces sont considérées comme non domestiques par la loi française, nécessite une compétence spécifique. Afin de répondre au mieux aux nouveaux besoins des professionnels de l'animalerie en matière de prophylaxie sanitaire, le vétérinaire doit prendre en compte l'organisation de la filière de commercialisation des NAC ainsi que les particularités de l'activité de vente et les impératifs économiques inhérents. Ceci est d'autant plus valable au rayon aquariophilie où les poissons sont soumis à de nombreux facteurs de stress dans les aquariums d'exposition qui augmentent leur sensibilité aux maladies. Le conseil des vendeurs animaliers dans l'identification et le traitement des maladies constitue la base des interventions du vétérinaire. Mais, ce dernier doit aussi développer conjointement les activités de conseil centrées sur la prévention des maladies telles que l'audit et le suivi vétérinaire global de ce rayon tout en s'impliquant dans d'autres domaines connexes tels que la sélection des fournisseurs et la formation du personnel animalier.