La morbidité et la mortalité des poulains durant leur première semaine de vie sont sources de pertes économiques fréquentes et importantes pour les éleveurs. L'état de léthargie du poulain nouveau-né est un signe d'appel fréquent, difficile à percevoir et non spécifique qui peut être le seul élément annonciateur d'une pathologie grave. Notre travail vise, d'une part, à décrire la présentation des premiers signes d'affections néonatales dans un effectif de poulains de Trait Comtois de la naissance à l'âge de sept jours. D'autre part, il a pour objectif de rechercher au sein de cet effectif la prévalence de deux grandes dominantes pathologiques en néonatalogie équine : la septicémie et le syndrome de malajustement néonatal ; ainsi que d'affections moins fréquentes liées aux carences en oligo-éléments. Nous n'avons pas pu mettre en évidence de relation entre les résultats de l'étude des concentrations en oligo-éléments et en thyroxine, et la faiblesse des nouveau-nés. En revanche, nous avons fait ressortir la présence des deux principales pathologies responsables de mortalité néonatale : la septicémie et le syndrome de malajustement néonatal. Ces deux affections tiennent une place centrale en terme de fréquence et de mortalité néonatale au sein du groupe de poulains que nous étudions. Elles sont souvent accompagnées d'un échec du transfert passif de l'immunité dans notre effectif de poulains comtois.