Le Rat noir (Rattus rattus) est le réservoir principal de la leptospirose, zoonose causée par les bactéries du genre Leptospira, en Afrique de l’Ouest. Evaluer le risque d’exposition de l’Homme aux leptospires représente un enjeu majeur en santé publique. A cette fin, deux modèles épidémiologiques ont été développés : un premier modèle permettant d’explorer la dynamique des populations de Rattus rattus de façon locale et la dynamique de transmission des leptospires au sein de celles-ci, et une version spatialisée du modèle précédent visant à évaluer l’influence d’une inondation, d’une part, sur la prévalence de la leptospirose dans les mêmes populations et, d’autre part, la distribution des leptospires dans l’environnement. Les paramètres démographiques et épidémiologiques de ces modèles ont été estimés à partir de données issues de trois sessions de capture menées dans trois quartiers de Cotonou, capitale économique du Bénin. Les résultats des simulations ont montré, entre autres, qu’une inondation pouvait être à l’origine d’une augmentation de la prévalence de la leptospirose chez Rattus rattus et d’une augmentation de l’exposition de l’Homme aux leptospires, l’ampleur de ces augmentations dépendant fortement de la topographie du milieu.