Entre mars 2016 et décembre 2019, plusieurs souris en lactation d'une animalerie de l'Ecole nationale vétérinaire d'Alfort (EnvA) ont été atteintes d'une entérite nécrosante aiguë (ENA) à l'origine d'une mort soudaine sans signe d'appel. Cette affection s'accompagnait systématiquement d'une distension abdominale causée par une dilatation et une nécrose de l'intestin. La littérature fait état de descriptions cliniques et lésionnelles similaires chez la souris en lactation sous différentes appellations : « ileus and paresis of peristalsis », « deficient lactation », « fatal acute intestine pseudoobstruction », « postpartum ileus », « lactation ileus ». Malgré ces descriptions, l'étiologie de cette maladie est à ce jour inconnue. Dans le but de caractériser cette maladie, nous avons réalisé une étude épidémiologique grâce à une base de données élaborée à partir des portées obtenues sur cette période. Ensuite, nous avons mené une étude histologique à partir de coupes d'intestins récoltés chez les souris mortes d'ENA et préparés avec une coloration hémalun-éosine-safran. Enfin, nous avons poursuivi l'étude étiologique commencée au laboratoire « Découverte de pathogènes » de l'Institut Pasteur. Grâce à un séquençage de Sanger, cette étude préliminaire a permis d'identifier deux agents viraux présents en quantité importante et responsables d'affections digestives chez d'autres espèces : un astrovirus (AVM) et un norovirus (NVM). La suite du projet consistait à quantifier ces virus par RT-qPCR sur un plus grand nombre d'échantillons. La seconde partie de l'étude étiologique visait à exclure deux agents bactériens évoqués dans la littérature par la mise en culture de C. perfringens et par l'amplification de séquences de C. piliforme par PCR nichée. L'étude épidémiologique a déterminé que l'occurrence de l'ENA chez la mère de la souris allaitante était un facteur de risque d'ENA. A l'inverse, l'âge de la femelle, le rang de parité, la taille de la portée n'étaient pas des facteurs de risque et la maladie ne se transmettait probablement pas sexuellement. L'étude histologique a permis de décrire deux profils lésionnels de l'ENA, de proposer une appellation pour cette lésion et d'exclure toute lésion de Clostridium. De plus, les cultures de C. perfringens se sont révélées négatives. Néanmoins, des aléas techniques et le manque de temps n'ont pas permis de réaliser la recherche virale par RT-qPCR et la recherche de C. piliforme par PCR nichées. A ce jour, l'origine de l'ENA reste inconnue mais nos données permettent d'avancer avec conviction une hypothèse virale et de préciser les données épidémiologiques de cette affection.

Url / Doi : https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-04075339v1/file/A-2022-093.pdf

Localisation : Env Alfort (Bibliothèque)

N° de thèse : 093

Bibliogr. p. : 89-95

Titre anglais : Epidemiological, histological and etiological characterization of an acute necrotizing enteritis in lactating mice of laboratory reseach

Résumé anglais : From March 2016 to December 2019, several lactating mice suddenly die from an acute necrotizing enteritis in an animal facility of the EnvA. Lactating mice died suddenly without premonitory signs and show abdominal distension with necrotizing and distended small intestine. Previous descriptionsreported similar clinical signs and gross lesions called as : ileus and paresis of peristalsis, deficient lactation, fatal acute intestine pseudoobstruction, postpartum ileus, lactation ileus. Despite several scientific papers, the cause of the disease remains unknown. In order to describe this condition, we realized an epidemiological study thanks to a database built from data obtained from mice of the animal facility. Then, we ran a histological study from intestinal samples using a hematoxylin and eosin stain. At last, we pursued the etiological study started by the Pasteur Institute. Thanks to Sanger sequencing, this preliminary study allowed to identify two viral agents capable of producing intestinal diseases in other species : an astrovirus (AVM) and a norovirus (NVM). The following step aimed at using a RT-qPCR to quantify those viruses on a greater scale. Another part of this study was to rule out two bacterial agents quoted in some research articles : C. perfringens by anaerobic culture and C. piliforme by nested PCR. The epidemiological study showed that the appearance of ENA in lactating mice's mother was a risk factor for ENA. By contrast, the age, the size of the litter, the parity of lactating mice were not risk factors and the disease was probably not transmitted sexually. The histological study described two typical lesional patterns and ruled out any hemorrhagic lesion in the affected mucosa. Besides, anaerobic culture for C. perfringens was negative. However, technical issues and lack of time did not allow us to perform RT-qPCR for AVM and NVM, and nested PCR for C. piliforme. Up to date, origin of the ENA is still unknown but our data strongly suggest a viral origin for this disease and provide insight on its epidemiological context.

Mots-clés anglais : Lactating mice . Acute necrotizing enteritis . Astrovirus . Norovirus . Clostridium perfringens . Clostridium piliforme

En ligne : Oui

Directeur de Thèse : Pilot-Storck, Fanny

Assesseur / Examinateur : Reyes Gomez, Edouard

Type de fond : Fonds contemporain

Emprunt/Réservation