La diphtérie est une maladie respiratoire grave quasiment éradiquée dans les pays développés. Elle est causée par des corynébactéries du complexe diphtheriae capables de produire la toxine diphtérique, responsable des symptômes de la maladie. Corynebacterium ulcerans est un agent pathogène émergent qui se distingue de l'agent historique de la diphtérie C. diphtheriae par ses caractéristiques épidémiologiques : C. diphtheriae est un agent pathogène strictement humain dont le mécanisme d'infection a été très étudié tandis que C. ulcerans est un agent pathogène zoonotique dont l'épidémiologie n'est pas complètement élucidée, ce qui soulève de nouveaux enjeux sanitaires. C. ulcerans peut être transmis à l'Homme par les chiens et les chats, qui pourraient se contaminer auprès d'espèces de la faune sauvage jouant un rôle de réservoir. Le portage de C. ulcerans au sein de la faune sauvage est néanmoins mal connu. Ce travail de thèse propose une synthèse bibliographique sur l'état des connaissances actuelles sur la diphtérie et les bactéries du complexe diphtheriae, puis une étude expérimentale en collaboration avec le Centre National de Référence (CNR) des Corynébactéries du complexe diphtheriae ayant pour objet la recherche par culture bactériologique et analyse qPCR des corynébactéries du complexe diphtheriae au sein de la faune sauvage française. Cette étude expérimentale nous a permis d'adapter les protocoles du CNR dans les laboratoires du BioPôle et de l'UMR Bipar (situés sur le campus de l'Ecole nationale vétérinaire d'Alfort), ce qui a notamment nécessité de résoudre des difficultés techniques. L'analyse de 235 prélèvements réalisés sur des oiseaux et des petits mammifères de la faune sauvage française par 205 qPCR et 67 cultures bactériologiques n'a pas permis d'identifier de corynébactéries du complexe diphtheriae et de repérer un éventuel réservoir. Ce résultat souligne la difficulté à délimiter les contours et l'ampleur du rôle joué par les espèces de la faune sauvage dans l'émergence des cas humains dus à C. ulcerans observée depuis une vingtaine d'années.

Url / Doi : https://theses.vet-alfort.fr/telecharger.php?id=4136

Localisation : Env Alfort (Bibliothèque)

N° de thèse : 112

Titre anglais : Research of corynebacteria from the diphtheriae complex in the french wildlife

Résumé anglais : Diphtheria is a severe respiratory disease nearly eradicated in developed countries. It is caused by corynebacteria belonging to the diphtheriae complex because of their potential ability to produce the diphtheria toxin, which is responsible for the symptoms. Corynebacterium ulcerans is an emerging pathogen which is different from the historical pathogen C. diphtheriae in regard to the epidemiology: C. diphtheriae is a strictly human pathogen whose infection mechanism is well known, whereas C. ulcerans is a zoonotic pathogen whose epidemiology is not completely elucidated, raising new concerns. C. ulcerans can be transmitted from dogs and cats to humans. Pets could get infected by contact with wildlife, which could be a reservoir. Nevertheless, the prevalence of C. ulcerans in wildlife is not known. This thesis offers a literature review of the current knowledge and hypothesis on diphtheria and an experimental study realized in collaboration with the diphtheriae complex National Reference Centre (CNR): we searched for corynebacteria from the diphtheriae complex in the French wildlife using bacteriological cultures and qPCR analyses. This experimental study enabled the adaptation of the protocols from the CNR to BioPôle and UMR Bipar laboratories (both located on the campus of the Ecole Nationale Vétérinaire d'Alfort), which required resolution of some technical difficulties. The analysis of 235 samples from wild birds and small mammals with 205 qPCR analysis and 67 bacteriological cultures did not identify any corynebacteria from the diphtheriae complex, thus we did not detect a reservoir in the French wildlife. This result underlines the difficulty to delimitate the edges and spread of the role played by wildlife in the emergence of C. ulcerans human cases that has been occurring for 20 years.

Mots-clés anglais : Diphtheria; Corynebacterium; Corynebacterium ulcerans; Corynebacterium diphtheriae; Corynebacterium pseudotuberculosis; Corynebacteria; Wildlife; Bacteria; Bacteriology; Molecular biology; Bird; Mammal; France

En ligne : Oui

Directeur de Thèse : Lagrée, Anne-Claire

Assesseur / Examinateur : Risco-Castillo, Veronica

Type de fond : Fonds contemporain

Emprunt/Réservation