Les entérites néonatales chez les bovins représentent un enjeu financier et sanitaire important pour les éleveurs. Leur origine est généralement multifactorielle et fait intervenir différents microorganismes tels que des bactéries (Escherichia coli), des virus (Coronavirus, Rotavirus) ou encore des parasites (Cryptosporidium parvum). Dans un contexte mondial où l'antibiorésistance est la problématique majeure de santé publique, notre étude vise à faire un état des lieux de l'évolution des résistances bactériennes et notamment chez Escherichia coli en prenant pour base les observations faites par Mlle Lacroute dans l'Allier de 2011 à 2013. Ainsi, durant les saisons de vêlages 2020-2021 et 2021-2022, des prélèvements de sang et de selles ont été réalisés, dans cette même région, sur 38 veaux malades et 40 veaux témoins de moins de 10 jours. Les prélèvements de selles ont été utilisés afin d'isoler une ou plusieurs colonies d'Escherichia coli pour en typer la souche et rechercher les éventuelles résistances aux différentes molécules antibiotiques utilisés couramment en médecine vétérinaire. Les échantillons de sang, quant à eux, ont servi à mesurer les taux d'immunoglobulines G présentes dans le sang des veaux afin de juger de l'efficacité du transfert colostral et de potentiellement permettre de faire une corrélation entre transfert colostral et le statut (malade ou témoin) du veau. Les taux de résistance aux antibiotiques calculés lors de notre étude sont pour la plupart similaires à ceux de l'étude de 2013, exceptés pour les taux de résistance aux antibiotiques critiques (fluoroquinolones et céphalosporine de 3ème et 4ème générations) en forte régression. Ce constat est particulièrement encourageant car il témoigne d'un fort recul des résistances à ces molécules, un des principaux objectifs des plan EcoAntibio 1 et 2 mis en place en 2012 et 2017. D'autre part, notre étude a révélé que la présence du gène de virulence CS31A chez Escherichia coli était presque systématiquement corrélée à la présence de gènes de résistance à l'amoxicilline, à la streptomycine et aux tétracyclines. Ceci pourrait s'expliquer par l'existence d'un plasmide bactérien porteur de ces gènes de résistance et de virulence. Une étude ultérieure visant à approfondir cette hypothèse pourrait se révéler intéressante.

Url / Doi : https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-04415224v1/file/A-2023-109.pdf

Localisation : Env Alfort (Bibliothèque)

N° de thèse : 109

Bibliogr. p. : 124-131

Titre anglais : Study of antibiotic resistance levels in E. Coli agent of neonatal diarrhea in calves : state of play ten years after the first study carried out in Allier between 2011 and 2013

Résumé anglais : Neonatal diarrhea in cattle represents a main health and financial issue for breeders. Their origin is generally multifactorial, involving a variety of microorganisms such as bacteria (Escherichia coli), viruses (Coronavirus, Rotavirus) or parasites (Cryptosporidium parvum). In a global context where antibiotic resistance is a major public health issue, our study aims to make a state of the art of the evolution of bacterial resistance, particularly in Escherichia coli, based on observations made by Miss Lacroute in the Allier between 2011 and 2013. During the 2020-2021 and 2021-2022 calving seasons, blood and feces were sampled from 38 diarrheic calves and 40 control calves under 8 days of age in the same region. The fecal samples were used to isolate one or more Escherichia coli colonies for strain typing, and to test for resistance to the various antibiotic molecules normally used in veterinary medicine. Blood samples were used to measure levels of immunoglobulin G in the calves' blood, in order to assess the effectiveness of colostral transfer and potentially to correlate colostral transfer with the status (diarrheic or control) of the calf. Antibiotic resistance rates calculated in our study are for the most part similar to those of the 2013 study, with the exception of resistance rates to critical antibiotics (fluoroquinolones and 3rd and 4th generation cephalosporins), which have fallen sharply. This finding is particularly encouraging, as it testifies to a sharp decline in resistance to these molecules, one of the main objectives of the EcoAntibio 1 and 2 plans implemented in 2012 and 2017. Our study also revealed that the presence of the CS31A virulence gene in Escherichia coli was almost systematically correlated with the presence of resistance genes to amoxicillin, streptomycin and tetracyclines. This could be explained by the existence of a bacterial plasmid carrying these resistance and virulence genes. Further investigation of this hypothesis could prove interesting.

Mots-clés anglais : Neonatal diarrhoea ; Escherichia Coli ; Immunity ; Fluidotherapy ; Antibiotherapy ; Alternative treatment ; Antibiotic resistance ; Calf ; Allier

En ligne : Oui

Directeur de Thèse : Millemann, Yves

Assesseur / Examinateur : Grimard-Ballif, Bénédicte

Type de fond : Fonds contemporain

Emprunt/Réservation