Les bovins sont, de par leurs particularités anatomiques respiratoires et leur environnement, des animaux prédisposés aux affections respiratoires. Ainsi, de très nombreux agents pathogènes bactériens, viraux et parasitaires peuvent être responsables de maladies respiratoires ayant un impact non négligeable sur la santé et sur les productions des troupeaux bovins. Le vétérinaire rural peut être appelé parfois à déterminer l'agent pathogène respiratoire principal responsable de ces affections et dispose de plusieurs modes de prélèvements comme l'écouvillonnage nasal profond (ENP), l'aspiration transtrachéale (ATT), le lavage broncho-alvéolaire (LBA) et le prélèvement de poumon. Cependant, ces prélèvements doivent être conservés et envoyés dans des conditions strictes de température notamment qui peuvent être contraignantes dans la pratique en milieu rural. Les cartes FTA® (Flinders Technology Associates) apparaissent alors comme un outil permettant de passer outre ces contraintes de stockage et pouvant être utiles lors de la pratique vétérinaire en milieu rural car elles permettent de conserver des prélèvements à température ambiante après avoir inactivé les agents pathogènes, et fixé l'ADN et l'ARN du prélèvement. Nous avons voulu, dans cette étude, déterminer si les cartes FTA® peuvent être utilisées de manière adaptée dans le diagnostic des maladies respiratoires chez les bovins en comparant des écouvillons et des cartes FTA® dopés avec une solution contenant une bactérie, Mannheimia haemolytica, et un virus, le Virus Respiratoire Syncytial Bovin à J0, J7 et J14 grâce à une PCR multiplex (comparaison de 2 concentrations à J0, J7 et J14, 3 répliquats par échantillon). Il apparait alors que la recherche des deux agents pathogènes respiratoires sur les écouvillons et les cartes FTA® ne présente pas de différence significative entre les deux matrices à J0, J7 et J14 et que le vieillissement est sans différence significative également. Ainsi, en raison des conditions de stockage et d'envoi bien plus facilitées pour les cartes FTA®, ces dernières apparaissent comme un outil largement utilisable en milieu rural en comparaison avec les ENP. Il serait intéressant d'effectuer une étude similaire avec d'autres agents pathogènes responsables de maladies respiratoires, ainsi qu'en comparant les autres matrices disponibles pour la recherche de ceux-ci avec les cartes FTA®.

Url / Doi : https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-04168518v1/file/A-2023-027.pdf

Localisation : Env Alfort (Bibliothèque)

N° de thèse : 027

Bibliogr. p. : 106-109

Titre anglais : Pertinence of utilisation of FTA® cards for samples shipment allowing diagnostic of bovine respiratory diseases

Résumé anglais : Due to their anatomical and respiratory characteristics and their environment, cattle are predisposed to respiratory diseases. Thus, many bacterial, viral and parasitic pathogens can be responsible for respiratory diseases that have a significant impact on health and production in cattle herds. The rural veterinarian may be called on at times to determine the primary respiratory pathogen responsible for these diseases and has several sampling methods such as deep nasal swab (DNS), transtracheal aspirate (TSA), bronchoalveolar lavage (BAL) and lung sampling. However, these samples must be stored and sent under strict temperature conditions, which can be restrictive in rural areas. FTA® cards (Flinders Technology Associates) appear as a tool to overcome these storage constraints and can be useful in rural veterinary practice because they can store samples at room temperature after inactivating the pathogens and fixing the DNA and RNA of the sample. In this study, we wanted to determine if FTA® cards can be used in a suitable way in the diagnosis of respiratory diseases in cattle by comparing swabs and FTA® cards spiked with a solution containing a bacterium, Mannheimia haemolytica, and a virus, the Bovine Respiratory Syncytial Virus, at D0, D7 and D14 thanks to a multiplex PCR (comparison of 2 concentrations at D0, D7 and D14, 3 replication by samples). It appears then that the detection of the two respiratory pathogens on the swabs and the FTA® cards does not present any significant difference between the two matrices at D0, D7 and D14 and that the ageing of samples is also without any significant difference. Thus, due to the much easier storage and shipping conditions for FTA® cards, the latter appear to be a widely usable tool in rural areas compared to DNSs. It would be interesting to carry out a similar study with other pathogens responsible for respiratory diseases, as well as by comparing other available matrices for their detection with FTA® cards.

Mots-clés anglais : Respiratory diseases, Bovine, Mannheimia haemolytica, Bovine respiratory syncytial virus, Sample, Diagnosis

En ligne : Oui

Directeur de Thèse : Millemann, Yves

Assesseur / Examinateur : Grimard-Ballif, Bénédicte

Type de fond : Fonds contemporain

Emprunt/Réservation