La diphtérie est une maladie respiratoire grave quasiment éradiquée dans les pays développés. Elle est causée par des corynébactéries du complexe diphtheriae capables de produire la toxine diphtérique, responsable des symptômes de la maladie. Corynebacterium ulcerans est un agent pathogène émergent qui se distingue de l'agent historique de la diphtérie C. diphtheriae par ses caractéristiques épidémiologiques : C. diphtheriae est un agent pathogène strictement humain dont le mécanisme d'infection a été très étudié tandis que C. ulcerans est un agent pathogène zoonotique dont l'épidémiologie n'est pas complètement élucidée, ce qui soulève de nouveaux enjeux sanitaires. C. ulcerans peut être transmis à l'Homme par les chiens et les chats, qui pourraient se contaminer auprès d'espèces de la faune sauvage jouant un rôle de réservoir. Le portage de C. ulcerans au sein de la faune sauvage est néanmoins mal connu. Ce travail de thèse propose une synthèse bibliographique sur l'état des connaissances actuelles sur la diphtérie et les bactéries du complexe diphtheriae, puis une étude expérimentale en collaboration avec le Centre National de Référence (CNR) des Corynébactéries du complexe diphtheriae ayant pour objet la recherche par culture bactériologique et analyse qPCR des corynébactéries du complexe diphtheriae au sein de la faune sauvage française. Cette étude expérimentale nous a permis d'adapter les protocoles du CNR dans les laboratoires du BioPôle et de l'UMR Bipar (situés sur le campus de l'Ecole nationale vétérinaire d'Alfort), ce qui a notamment nécessité de résoudre des difficultés techniques. L'analyse de 235 prélèvements réalisés sur des oiseaux et des petits mammifères de la faune sauvage française par 205 qPCR et 67 cultures bactériologiques n'a pas permis d'identifier de corynébactéries du complexe diphtheriae et de repérer un éventuel réservoir. Ce résultat souligne la difficulté à délimiter les contours et l'ampleur du rôle joué par les espèces de la faune sauvage dans l'émergence des cas humains dus à C. ulcerans observée depuis une vingtaine d'années.[-]