La pneumonie bactérienne est une dominante pathologique chez le poulain entre 1 et 6 mois. De nombreuses bactéries peuvent être impliquées, mais deux bactéries sont particulièrement importantes, Streptococcus zooepidemicus en raison de sa fréquence et Rhodococcus equi en raison de la gravité de la pneumonie qu'il engendre. Les signes cliniques sont assez variables mais une tachypnée et de l'hyperthermie sont généralement présentes. Un diagnostic précoce est essentiel, surtout dans le cas de la pneumonie à Rhodococcus equi. Le traitement repose sur l'association d'un traitement antibiotique pouvant être très long, et de mesures complémentaires visant à procurer au poulain un confort optimal. La prévention est essentiellement sanitaire avec une bonne gestion de l'élevage et des poulinages. Des mesures prophylactiques commencent à se développer mais elles sont encore insuffisantes. Le pronostic reste difficile à établir.