La biologie moléculaire permet de proposer une nouvelle taxinomie et de mieux comprendre l'évolution du genre Lyssavirus. Elle classe les Lyssavirus en sept génotypes et définit plus précisément ce genre au sein de la famille des Rhabdoviridae. Dans chaque génotype, des sub-divisions apparaissent, regroupant les isolats en fonction de la région géographique et de la catégorie d'hôtes vecteurs. A faible distance évolutive, la biologie moléculaire a un impact en épidémiologie. La réalisation d'études localement permet de contrôler l'extension des cycles de transmissions. L'analyse phylogénétique plus générale du genre Lyssavirus supporte l'idée d'un passage historique des virus de chauves-souris à la faune terrestre et doit nous alerter sur le risque d'une nouvelle extension.