L'objectif de cette étude était de produire des références sur la circulation de 5 agents pathogènes avant la mise en lot et pendant les semaines après celle-ci dans les élevages de jeunes bovins en Pays de Loire. Pour cela, un prélèvement sanguin a été réalisé à la mise en lots, et un autre 6 semaines plus tard sur 731 jeunes bovins issus de 52 élevages des Pays de Loire afin de déterminer leur statut sérologique vis-à-vis des virus VRSB, PI3, BVD et IBR et de la bactérie Mycoplasma bovis par techniques ELISA. A la mise en lot les prévalences des différents agents pathogènes étaient de 56 % pour le PI3, 48% pour Mycoplasma bovis, 29 % pour le VRSB, 17% pour le BVD et 2% pour l'IBR. Les jeunes bovins plus âgés et plus lourds, ainsi que ceux qui ont été mis en lot au mois de janvier et février avaient des pourcentages de séropositivité à la mise en lots plus importants. Les pourcentages de séroconversion à 6 semaines ont été calculé sur les jeunes bovins exposés à la séroconversion. Les résultats obtenus pour la séroconversion à 6 semaines sont de 81% pour le VRSB, 70% pour le PI3, 67% pour Mycoplasma bovis, 30% pour le BVD et 3% pour l'IBR. Ces pourcentages augmentaient avec l'hétérogénéité de provenance du lot, et étaient plus importants quand les jeunes étaient mis en lots au mois de septembre et d'octobre. Au niveau du lot, les pourcentages de séroconversion étaient similaires avec ceux obtenus au niveau individuel : 81% des lots ont séroconverti pour le VRSB, 70% pour le PI3, 67% pour Mycoplasma bovis, 64% pour le BVD et 5% pour l'IBR. L'étude montre également une augmentation significative du risque d'apparition des troubles respiratoires lorsque les jeunes bovins ont séroconverti pour les agents pathogènes.