L’Asie est reconnue comme étant un « hotspot » pour l’émergence de maladies infectieuses, dont de nombreuses zoonoses comme la leptospirose. En Asie du Sud-Est, cette maladie est un problème majeur de santé publique mais reste pourtant peu étudiée, en particulier dans la faune sauvage. Les rongeurs en sont le principal réservoir et l’homme s’infecte au contact de l’eau contaminée ou d’urine de rongeurs infectés. L’incidence de la leptospirose est saisonnière et l’infection est plus fréquente en zones rurales. Grâce au projet CERoPath (Ecologie des Communautés de Rongeurs et de leurs Pathogènes en Asie du Sud-Est), 940 rongeurs issus de sept localités ont été testés pour la leptospirose grâce à la méthode de PCR quantitative que nous avons développée. Celle-ci cible le gène codant pour l’ARNr 16S et celui codant pour la lipoprotéine LipL32. Ensuite, nous avons mis en évidence des facteurs déterminants de l’infection chez les rongeurs parmi les variables environnementales et individuelles, l’abondance, la richesse spécifique et la diversité de rongeurs de chaque localité. Nous avons montré que la prévalence du portage des leptospires chez les rongeurs est très variable selon la localité. En revanche, toutes les espèces de rongeurs qui ont été suffisamment échantillonnées se sont avérées être porteuses de leptospirose, la plupart du temps de souches pathogènes. Les facteurs influençant la probabilité d’infection chez les rongeurs sont l’abondance et la richesse spécifique, le sexe des rongeurs, les précipitations de la session de capture et la latitude. Ces résultats sont cohérents avec les données humaines et permettront d’établir des cartes de risque de transmission des leptospires des rongeurs à l’homme.