Cette étude décrit la variabilité d’excrétion de Mycobacterium avium paratuberculosis à l’échelle individuelle et du troupeau, à un instant t et dans le temps. L’objectif est de déterminer si des profils d’excréteurs forts et/ou persistants existent pour les réformer en priorité dans les troupeaux infectés. Le lait et les fèces de 1861 bovins de plus de deux ans issus de 43 troupeaux infectés ont été prélevés. Les fèces ont été analysées par PCR directe pour tous les individus et par PCR post-culture en milieu liquide pour 628 d’entre eux. Le lait a été analysé par ELISA. De plus, le sang et les fèces de 402 bovins de plus de 14 mois issus de trois troupeaux infectés ont été prélevés deux à quatre fois par an. Les fèces ont été analysées par PCR post-culture en milieu liquide et le sérum a été analysé par ELISA. D’après les résultats, un groupe d’excréteurs persistants a été mis en évidence. De plus, les forts excréteurs sont majoritairement âgés de deux à quatre ans et/ou en première lactation. Un résultat positif simultané en PCR et en ELISA sur sérum permet de dépister 20% des excréteurs persistants. Le caractère fort et/ou persistant de l’excrétion pourrait constituer un critère de réforme.