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Analyse du polymorphisme génétique de loups à crinière (Chrysocyon brachyurus) dans l'Etat de São Paulo, Brésil, en vue d'un futur programme de reproduction en captivité

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Thèse

Url / Doi : https://theses.vet-alfort.fr/telecharger.php?id=2293

Localisation : Env Alfort (Bibliothèque)

N° de thèse : 034

Bibliographie : 226

Titre anglais : Analysis of the genetic polymorphism of maned wolves (Chrysocyon brachyurus) in Sao Paulo State, BRAZIL, with the aim of a futur reproduction programme in captivity

En ligne : Oui

Directeur de Thèse : Tiret, Laurent

Assesseur / Examinateur : Fontbonne, Alain

Type de fond : Fonds contemporain

Le loup à crinière (Chrysocyon brachyurus) est le plus grand canidé d'Amérique du Sud. Plus de 90 % des individus constituant la population libre répertoriée actuellement vit sur le territoire brésilien. La déforestation qui détruit son habitat naturel et le rapproche des territoires humains constitue une menace pour sa préservation. Le loup à crinière figure aujourd'hui parmi les espèces « quasi menacées » de la Liste Rouge de l'Union Internationale pour la Conservation de la Nature. Ceci est en partie dû au fait que cet animal est solitaire et difficilement observable, ce qui complique l'actualisation de son statut de conservation. D'après les études disponibles sur Chrysocyon brachyurus, l'espèce souffrirait d'une érosion de sa diversité génétique, justifiant la mise en place d'un programme de sélection rigoureux au sein de la population captive pour favoriser des croisements entre individus de génomes les plus polymorphes possibles. À ces fins, nous avons décidé de mener une analyse de la diversité génétique de dix loups à crinière captifs résidant dans l'État de São Paulo, pour lesquels nous avons extrait de l'ADN génomique à partir de prélèvements sanguins. À partir d'un panel de 12 marqueurs microsatellites canins amplifiables et préalablement identifiés comme étant polymorphes chez le loup à crinière, nous avons sélectionné cinq marqueurs pour notre étude. Le génotypage des dix loups à crinière disponibles pour ces cinq marqueurs a permis de révéler du polymorphisme entre les individus pour quatre de ces marqueurs. Ces résultats sur quatre loci isolés sont encourageants et cette étude a permis d'établir les bases d'un protocole d'analyse génétique efficace par génotypage. À l'avenir, il serait intéressant de développer des amorces spécifiques à l'espèce Chrysocyon brachyurus pour permettre une analyse statistique robuste. En attendant, l'étude des programmes de reproduction déjà en place chez cette espèce a révélé de très bons résultats et une bonne gestion de la population captive. Cependant, il semble néanmoins que la communication entre les différentes institutions impliquées dans la conservation du loup à crinière n'est pas toujours efficace et gagnerait à être améliorée. Cette étude permet de donner une actualité sur Chrysocyon brachyurus et de faire connaître cette espèce méconnue du grand public afin de sensibiliser la population à son statut de conservation précaire.

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