Le système immunitaire est capable, en discriminant le soi du non-soi, de détruire de nombreux agents pathogènes. Par leurs récepteurs à l’antigène, les lymphocytes T reconnaissent les épitopes présentés par le CMH. Le TCR est le support de la diversité de reconnaissance appelée « répertoire T ». La construction de ce répertoire a lieu dans le thymus pendant l’ontogénie lymphocytaire et est régulée par des mécanismes génétiques complexes. Ce travail a pour objectifs d’étudier l’impact du répertoire T sur les maladies autoimmunes et la vaccination chez le chien. Des dysfonctionnements lors des processus thymiques, peuvent développer desmaladies auto-immunes. Trois d’entre elles : le diabète mellitus, la polymyosite et la myasthenia gravis, sont étudiées et font intervenir différents mécanismes impliquant les lymphocytes T. Le diabète se développe à cause d’une absence de tolérance centrale impliquant le gène AIRE, la polymyosite par une rupture de tolérance périphérique, et la myasthénie pas une dysrégulation des LT CD4+ régulateurs.Le répertoire T joue également un rôle crucial dans la réponse vaccinale. Combiné à la diversité génétique du CMH caractérisant chaque individu, la diversité du répertoire explique une différence individuelle d’efficacité de la vaccination pour un même antigène, nécessitant l’adaptation des préparations vaccinales. Dans ces deux contextes, la variabilité du répertoire T repose sur des mécanismes non encore totalement élucidés. Ces connaissances présentent un intérêt indéniable pour le développement de ces domaines d’importance tant en médecine vétérinaire qu’humaine et pour lesquels le chien peut représenter un modèle d’étude comparée.