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Etude comparative du diagnostic de laboratoire de la fièvre Q lors d'avortements bovins (méthode QPCR versus analyses histologiques sur placentas)

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Thèse
H

Guerineau, Simon

2018

130 p.

N-2018-095

Fièvre Q ; Coxiella burnetii ; Vache ; Avortement ; Placenta ; Histologie ; Réaction de polymérisation quantitative

Url / Doi : https://doc-veto.oniris-nantes.fr/ListRecordVisio.htm?idlist...

Localisation : Oniris Chantrerie Documentation

N° de thèse : 95

Titre anglais : Comparative study of the Q fever laboratory diagnosis methods in cattle abortions (quantitative PCR method versus histology on placentas)

Cette étude a été réalisée sur 59 placentas de vaches avorteuses provenant de troupeaux vendéens afin de répondre à deux objectifs principaux dans la démarche d’imputabilité des avortements à Coxiella burnetii : déterminer les sensibilité et spécificité de la qPCR en comparaison à la référence histologique, suivant les différents seuils de positivité en qPCR (101 à 108 bactéries/mL) ; comparer l’apport diagnostique des différents supports de prélèvement (placenta, écouvillons viscose ou coton) dans la réalisation de qPCR. L’accord qPCR/histologie est globalement faible, maximisé au seuil qPCR de 104 bactéries/mL (? = 0,23). La sensibilité de la qPCR est faible (25%) mais la spécificité est excellente (95%) : un abaissement du seuil à 103 permettrait ainsi de favoriser les détections en conservant un bon niveau d’imputabilité. Pour diminuer les perturbations diagnostiques par des facteurs tels que l’autolyse placentaire, il est important d’insister sur la précocité de réalisation du prélèvement et la rapidité de son acheminement au laboratoire sous couvert de froid. L’étude des 55 séries exploitables de 3 qPCR ne montre pas d’effet majeur du choix du support de prélèvement sur la quantification bactérienne : les supports sont donc interchangeables. Pour des raisons logistiques, l’utilisation d’écouvillon viscose est préférable. L’accord des résultats qualitatifs fournis par les 3 types de support est maximisé au seuil de 103 bactéries/mL.

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