De la déforestation massive que subit le Cambodge découle des changements drastiques de la composition des communautés de petits mammifères. A travers ce processus de transformation des terres, la réémergence des maladies zoonotiques est attendue. Le but de cette étude est de déterminer les mécanismes qui entrainent l?émergence de la leptospirose au sein des communautés de rongeurs au cours du processus de déforestation dans les provinces de Mondulkiri et San Dan au Cambodge. Nous nous concentrons sur le lien entre les changements de composition des communautés de rongeurs et leur statut infectieux de leptospirose. Pour ce faire, des pièges de rongeurs et des techniques de capture-marquage-recapture ont été utilisés pour investiguer la diversité, l?abondance et la composition des communautés de rongeurs lors de la transformation d?un habitat de type forêt en une zone cultivée. Nos résultats montrent que la composition des communautés de rongeurs diffère au cours du gradient de déforestation. Les mâles Mus spp. présentent une probabilité de capture inférieure aux femelles mais une probabilité d?infection par les leptospires supérieure aux femelles. Ainsi, la prévalence apparente de Leptospira de Mus spp. est sous-estimée durant la saison sèche dans les zones cultivées.