Le microbiote intestinal des mammifères est un sujet d'étude qui présente un intérêt grandissant, notamment en raison de ses nombreuses implications dans la santé de l'hôte. Les données scientifiques actuelles sur le microbiote intestinal concernent principalement l'humain et les rongeurs de laboratoire. Récemment, des équipes scientifiques se sont penchées sur la caractérisation du microbiote intestinal des carnivores domestiques ; toutefois, les études décrivant le microbiote félin sont relativement peu nombreuses et le plus souvent restreintes à des cohortes de faible taille. De plus, à l'heure actuelle, il n'existe aucun consensus concernant les méthodes de prélèvement adaptées pour l'étude du microbiote félin. Notre objectif global est d'analyser un grand nombre de spécimens fécaux de chats tout-venant, afin de caractériser le microbiote fécal félin et de rechercher d'éventuelles signatures microbiennes liées à des variables de l'hôte (race, alimentation, etc.). Cette thèse constitue la première étape de ce projet d'envergure : la mise en place d'une coprothèque féline. Quatre-vingt-un spécimens fécaux ont été récoltés sur une période d'un an et demi. Le nombre de prélèvements est inférieur à nos attentes, néanmoins, les données obtenues lors de cette étude nous ont permis de mettre en lumière les contraintes liées à la collecte de selles de chats domestiques. Ainsi, nous proposons des protocoles de récolte fécale adaptés à la fois à la conservation optimale des micro-organismes fécaux pour leur analyse ultérieure et aux comportements félins.[-]