L'identification de la microflore staphylococcique commensale de la marmotte a ete l'objet de la presente these. Cette identification represente un interet taxonomique mais egalement une base de donnees utilisable pour l'etude des dermatites de la marmotte americaine. Cette derniere est un modele experimental animal de l'hepatite b de l'homme. La microflore staphylococcique de la marmotte etudiee est composee de souches de Staphylococcus simulans (68%), Staphylococcus haemolyticus (24%), Staphylococcus lentus (4%), Staphylococcus aureux (2%) et quelques souches de Staphylococcus sciuri, Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus warneri. Des souches de Macrococcus caseolyticus, jusqu'ici isolees uniquement chez les bovins, une baleine et dans les denrees alimentaires (Kloos et al. 1998) ont aussi ete mises en evidence chez la marmotte. Ceci confirme par ailleurs la proximite des genres Macrococcus et Staphylococcus. La methode employee a permis de selectionner et de caracteriser rapidement les souches appartenant au genre Staphylococcus et a ses genres apparentes phenotypiquement (Macrococcus et Stomatococcus). La combinaison du biotype (galerie ID32 Staph - bioMerieux) et du genotype (technique PCR-ITS 16s-23SrDNA, Polymerase Chain Reaction - Internal Transcribed Spacer) a permis une tres bonne identification des souches des differentes especes et sous-especes decrites, appartenant aux trois genres precites.