Les kératoconjonctivites sont des inflammations oculaires fréquemment rencontrées chez le chien et le chat. L'étiologie peut être très variée. Lorsque la clinique n'est pas évocatrice, il est essentiel que le clinicien soit capable de choisir l'examen complémentaire le plus approprié en fonction de ses hypothèses diagnostiques, de le réaliser et d'interpréter ses résultats ou ceux du laboratoire. Cette étude rappelle les investigations cytologiques et histopathologiques de la cornée et de la conjonctive, leurs indications et leurs interprétations. L'apport de ces examens complémentaires est également inclus dans la démarche diagnostique des kératoconjonctivites.