Les bronchopneumonies infectieuses des bovins sont des affections multifactorielles fréquentes et majeures des jeunes bovins dues à des agents pathogènes bactériens et viraux agissant en synergie avec des facteurs environnementaux et d’élevage. Les agents pathogènes peuvent agir seuls ou en association, leurs prévalences dépend des régions et des systèmes de production. Par ailleurs la nature et la fréquence des coinfections sont encore peu documentées. L’objectif de cette étude était d’évaluer la prévalence (par RT-PCR ou PCR multiplex) en élevages naisseurs de 7 agents infectieux (VRSB, bPI3, BCoV, P. multocida, M. haemolytica, H. somni, M. bovis), conjointement dans l’appareil respiratoire superficiel (écouvillonnage nasal ENP) et profond (lavage bronchoalvéolaire ou LBA). Un total de 28 élevages a été intégré dans l’étude. Aucun agent pathogène n’a pu être détecté chez 6,8% des LBA et 10% des ENP. Les co-infections sont largement mises en évidence dans cette étude : 58% des LBA et 70% des ENP comportent deux agents pathogènes ou plus. P. multocida, le BCoV, H. somni et le VRSB sont les agents les plus fréquemment associés. Enfin des différences ont été observées selon le type de prélèvement : l’ENP permet de détecter plus fréquemment le bCoV, M. haemolytica et le bPI3. A l’inverse la prévalence du VRSB est plus importante dans les LBA.