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Détection et identification de lagovirus chez diverses espèces de lagomorphes

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Thèse
H

Goepfert, Romain

École nationale vétérinaire de Toulouse

2018

153 p.

T-2018-098

Pathologie ; Lagomorphe ; Génétique ; Souche virale ; Hôte réservoir ; Calicivirus ; Lapin ; Lièvre d'Europe

Url / Doi : https://oatao.univ-toulouse.fr/25400/

Localisation : Env Toulouse (Bibliothèque)

N° de thèse : 98

Titre anglais : Detection and identification of lagoviruses among various lagomorph species

En ligne : Oui

Type de fond : Fonds dématérialisé

Les Lagovirus regroupent les virus responsables de la maladie hémorragique du lapin (RHDV) et du syndrome du lièvre brun européen, affections très souvent létales et contagieuses chez plusieurs espèces de lagomorphes. Bien que le RHDV ait longtemps été considéré comme spécifique d’Oryctolagus cuniculus, de nombreux variants génétiques virulents pour un plus large panel d’espèces ont émergés. Par ailleurs, plusieurs virus génétiquement proches du RHDV mais non pathogènes ont été identifiés. Les analyses phylogénétiques et épidémiologiques de tous ces différents virus suggèrent que l’évolution des Lagovirus pourrait être expliquée ou bien par sauts d’espèces avec passage du virus d’un hôte réservoir à un hôte sensible, ou bien par l’acquisition du caractère pathogène via des modifications génétiques chez des variants apathogènes. Cette présente étude a pour visée de compléter les données actuelles via la détection et le séquençage de souches non pathogènes ainsi que d’élaborer une méthode de détection des Lagovirus plus performante. Ce travail présente le séquençage de 4 souches dont les analyses suggèrent un rapprochement génétique avec les virus non pathogènes connus ainsi que l’élaboration d’une qPCR multiplex.

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