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Influence de la séquence nucléotidique sur le taux d'erreur des polymérases des virus influenza A

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Thèse
H

Lamont, Paul

École nationale vétérinaire de Toulouse

2023

121 p.

T-2023-008

Grippe aviaire ; Hémagglutinine ; Mutation

Les virus influenza aviaires hautement pathogènes représentent un enjeu économique et sanitaire majeur. Il n'est actuellement pas possible de prédire l'émergence de ces virus. L'objectif du projet RISKEVOL est de comprendre comment la séquence de l'hémagglutinine pourrait influencer l'acquisition d'un site de clivage polybasique. Ce travail a permis l'élaboration d'une nouvelle méthode d'analyse des mutations de l'hémagglutinine qui permet de s'affranchir de la pression de sélection, le système mini-génome 977. Il consiste à reconstituer le complexe polymérase du virus H7N1 977 pour répliquer des séquences ARN d'intérêt. Il a été utilisé avec les séquences HA des virus H5N3 ShimH5 et ShimH524a2b. Les ARN produits ont été séquencés par une méthode de séquençage haut débit et les résultats convergent avec ceux obtenus par d'autres méthodes produites par l'UMR 1225 IHAP : la séquence nucléotidique exerce une influence sur le taux d'erreur des polymérases des virus influenza aviaires.

Url / Doi : https://dumas.ccsd.cnrs.fr/dumas-04160709

Localisation : Env Toulouse (Bibliothèque)

N° de thèse : 8

Bibliogr. p. : 108-121

Titre anglais : Influence of nucleotide sequence on the error rate of polymerases of influenza A viruses

En ligne : Oui

Type de fond : Fonds dématérialisé


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