Une étude de 2016 a mis en évidence une prévalence de l'infection par Anaplasma ovis de 51,6% chez les caprins en Corse. Les mêmes prélèvements ont été utilisés dans le but de réaliser la caractérisation moléculaire des souches d'A. ovis circulant sur l'île. Pour cela, 3 reconstructions phylogénétiques ont été réalisées à partir de l'analyse de 2 gènes: le gène de la citrate synthase gltA et le gène de la protéine de surface 4 msp4. Une faible diversité génétique d'A. ovis chez les caprins en Corse a été mise en évidence, avec la présence d'une unique souche prédominante. L'analyse phylogénétique des séquences protéiques de la protéine de surface MSP4 montre que cette souche est étroitement liée à d'autres variants isolés dans 4 pays du bassin méditerranéen (Chypre, Espagne, Serbie et Tunisie) ainsi qu'en Mongolie et aux états-Unis. Ces liens phylogénétiques peuvent s'expliquer soit par une origine commune des souches qui ont ensuite divergé (avant ou après séparation géographique (homologie) ; soit par des mutations similaires de leur séquence ADN sans origine commune (homoplasie). à l'heure actuelle il n'est pas possible de faire la distinction. Le panel de séquences du gène msp4 utilisé dans cette étude n'est pas représentatif de toutes les souches présentes dans le monde entier. Il serait intéressant à l'avenir de trouver des régions génomiques plus variables que le gène msp4 pour préciser la phylogéographie mondiale d'A. ovis. Une étude similaire réalisée chez les ovins en Corse serait aussi très intéressante pour confronter les génotypes mis en évidence.