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Influence de la structure spatiale sur la diversité génétique : fragmentation de l'habitat sur des populations simulées

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Thèse

Chenin, Nathalie

École nationale vétérinaire de Toulouse

2013

47 p.

T-2013-072

Génétique des populations ; Simulation ; Habitat ; Conservation des espèces ; Structure ; Espace

Téléchargeable : Non

N° de thèse : 072

Bibliographie : 48

Titre anglais : Influence of spatial structure on genetic diversity : habitat fragmentation on simulated populations

Type de fond : Fonds contemporain

On sait que la fragmentation d’un habitat a de nombreux effets sur sa population, en particulier sur sa diversité génétique et sa différenciation. Il existe des méthodes qui sont couramment utilisées pour déceler des signes de réduction de taille de population dans le passé (les goulots d’étranglement), et les patrons d’isolation par la distance sont souvent utilisés pour explorer la diversité génétique d’une population. Cependant, aucune de ces méthodes n’a été conçue avec à l’esprit des considérations d’ordre spatial. En effet, jusqu’à présent très peu d’études ont employé des techniques de modélisation prenant en compte la dimension spatiale. Notre étude est fondée sur un program récent, SINS (pour Simulating INdividuals in Space en anglais), qui permet de modéliser de manière plus réaliste des variations géographiques. Nous avons simulé 4 principaux scénarii de fragmentation, et les premiers résultats qui en découlent montrent que diversité génétique et différenciation ne varient pas uniquement dans le temps, mais aussi dans l’espace (patrons d’isolement par la distance, habitat central contre habitat sur les bords, relations entres fragments d’habitat de différentes tailles). Cela jette donc le plus grand doute sur le fait que la structure spatiale puisse raisonnablement être de nouveau ignorée dans des études ultérieures.

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