L'administration d'antibiotiques pour le traitement des infections bactériennes entraîne une pression de sélection sur les bactéries commensales et favorise l'émergence et la sélection de bactéries résistantes. L'objectif de cette thèse était de déterminer l'impact de l'administration systémique de polymyxine B/minocycline sur la sélection de résistance dans la flore digestive chez le porc. Pour cela, nous avons prélevé les fèces de 24 porcelets avant, pendant et après un traitement par voie intraveineuse de minocycline. Ces porcelets étaient divisés en trois groupes, le groupe HD (high-dose) recevant une forte dose d'antibiotique (16 mg/kg), le groupe LD (low-dose) recevant une faible dose (8mg/kg) et le groupe T (témoin) ne recevant pas d'antibiotique. Nous avons mesuré l'impact de la combinaison de traitement sur la flore bactérienne facilement cultivable, les Entérobactérales . Nous avons déterminé l'évolution du nombre d'Entérobactérales en UFC/g de fèces et de la proportion d'Entérobactérales résistantes à la minocycline chez les trois groupes de porcs. Nous avons mis en évidence que l'administration d'une dose forte d'antibiotique (16 mg/kg) par voie intraveineuse entrainait une augmentation de la proportion de bactéries résistantes chez les Entérobactérales commensales durant la période de traitement et post-traitement immédiat. L'étude des modifications génotypiques de la flore totale survenues suite au traitement permettra de mieux caractériser l'évolution du microbiote au cours du traitement.[-]