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Evaluation de l'intérêt du séquençage du gène rpoB pour l'identification des bactéries du genre Mycoplasma

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Thèse

Localisation : Env Alfort (Bibliothèque)

N° de thèse : 100

Bibliographie : 114

Titre anglais : Evaluation of interest of rpoB sequencing to identify bacteriae of mycoplasma genus

En ligne : Non

Type de fond : Fonds contemporain

Les mycoplasmes sont pahogènes ou non et sont difficiles à cultiver. L'identification conventionnelle se fait par sérotypage par des laboratoires spécialisés. Pour ces bactéries, les techniques d'identification moléculaire ont un intérêt certain. Le webitiel BIBI permet une automatisation de l'identification bactérienne par séquençage, sur une base phylogénétique. Notre étude a consisté à développer un BIBI spécialisé pour les mycoplasmes. Des banques de données propres pour les séquences des gènes rrs et rpoB issues des souches types ont été établies. La banque rpoB a été complétée pour une majorité des espèces manquantes après développement d'un test PCR spécifique. A partir des banques rrs et rpoB, deux arbres phylogénétiques ont été construits par la méthode du maximum de vraisemblance. La base rrs peut apporter une aide à l'identification de la plupart des espèces de mycoplasmes. Des résultats complémentaires doivent être obtenus pour évaluer l'intérêt réel du séquençage de rpoB.

Emprunt/Réservation

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Exemplaires

Nbre d'exemplaires : 1
Cote / Code barre Localisation Commentaire
1 0000010944 [disponible] YRéserver
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