La transplantation de microbiote fécal est une nouvelle possibilité de traitement de plus en plus étudiée en médecine humaine et vétérinaire. Les récentes découvertes sur les relations qu’entretient un individu avec sa flore intestinale ouvrent de nombreuses perspectives thérapeutiques à cette technique, notamment dans le cadre des maladies chroniques digestives. L’auteur présente le cas clinique d’un chien Rottweiler de un an et deux mois, atteint depuis environ un an d’une diarrhée chronique, d’étiologie inconnue et réfractaire aux traitements antibiotique et corticoïde. Un essai de transplantation de microbiote fécal par lavement de rétention intestinal a été expérimenté en l’absence de tout autre médicament. L’aspect et la consistance des selles ont ensuite été évalués régulièrement pendant trois mois. Des résultats similaires à ceux rapportés en médecine humaine ont été obtenus. Les symptômes se sont nettement améliorés en quelques jours et cela a perduré durant tout le suivi de trois mois. Cependant, une légère dégradation de la consistance des selles a été observée au long terme. Une nouvelle transplantation de microbiote fécal pourrait être envisagée en cas de récidive ultérieure. Cette thèse apporte une analyse des différentes études réalisées en médecine humaine sur les possibilités de traitement et l’efficacité de la transplantation de microbiote fécal. Elle a pour objectif d’aider à comprendre l’implication du microbiote intestinal dans le développement de certaines maladies chroniques. Elle fournit, de plus, un protocole simple et peu coûteux aux vétérinaires souhaitant développer la transplantation de microbiote fécal au sein de leur pratique clinique.