L'endocardite infectieuse est la conséquence d'une contamination de l'endocarde valvulaire ou pariétal par un micro-organisme bactérien ou mycotique. Il en résulte localement des lésions végétatives ou ulcérées. Les études montrent que chez les carnivores domestiques certaines bactéries sont préférentiellement retrouvées lors d'endocardites infectieuses. Ainsi, les streptocoques sont identifiés comme germes responsables dans 17 à 24% des endocardites infectieuses canines, avec dans ce cas une atteinte beaucoup plus fréquente de la valve mitrale. De même, les bartonelles seront retrouvées dans 19 à 28% des cas, avec une atteinte préférentielle de la valve aortique. On retrouve également mais à une moindre fréquence, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae et Erysipelothrix rhusiopathiae. L'identification bactériologique du germe est essentielle afin de réaliser un traitement antibiotique ciblé. Cette connaissance passe par l'hémoculture qui doit être faite le plus tôt possible et de préférence avant tout traitement antibiotique. Ces connaissances sont également essentielles dans la prévention des endocardites infectieuses, particulièrement lors de gestes bucco-dentaires sur des animaux présentant des pathologies cardiaques.